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Bicomb最新安装包和说明书一次下载
2021-5-22 19:12
下载链接目前放在: The Ciitool Platform ,页面底部有一个download链接。
个人分类: 文献计量学|399 次阅读|没有评论
BICOMB出现没有注册类问题的解决
2021-4-29 14:34
最近遇到BICOMB软件“没有注册类”问题的同学很多: 跟开发人员沟通猜测是win10系统终止了对flashplayer的支持,导致软件左侧的动画不能显示。 好在这个不是很重要的功能,因此决定做一个补丁,去掉flash显示的功能,把这个补丁直接放到原先软件的安装目录下,替代原先的可执行文件即可。网站不允许上传exe文件, ...
个人分类: 文献计量学|691 次阅读|没有评论
基于R语言的PubMed信息抽取工具
2021-1-23 12:21
暂时名字叫做PubMR,放在GitHub上。 建设中,因此还不完善,欢迎大家使用,有什么问题和需求大家尽可能提出来,打算作为bicomb的升级版。 https://github.com/xizhou/pubMR
个人分类: 生物医学文本挖掘|902 次阅读|没有评论
Bicomb针对PubMed不能下载xml格式的补丁
热度 1 2020-7-23 11:34
把这个可执行文献复制到目录里,覆盖原有的文件就可以了。 在pubmed网站下载pubmed格式,用软件里的pubmed-2模板进行分析。 提取后,主题词的星花可以通过批量修改去掉。 目前上传一个压缩包,解压缩后应该可以使用。 安装包.rar 稍后可以到这个地址下载: https://www.cmu.edu.cn/dmi/nr.jsp?urltype=news.Ne ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|1994 次阅读|3 个评论 热度 1
MeSHy:Mining unanticipated PubMed information
2020-7-13 16:41
T. Theodosiou et al. / Journal of Biomedical Informatics 44 (2011) 919–926 The basic assumption is that the terms that have almost the same probability of being observed within the results of a query and also in the entire PubMed database (excluding the results of the query) do not contain imp ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|1314 次阅读|没有评论
BICOMB下载网址及升级
热度 1 2020-7-13 09:38
学校网站调整,bicomb的下载地址变更为: https://www.cmu.edu.cn/dmi/nr.jsp?urltype=news.NewsContentUrlwbtreeid=2161wbnewsid=4589archive=0 ;途径是中国医科大学-院系-医学信息学院-科学研究-科研成果-书目共现分析系统bicomb。 关于PubMed数据库最近下载格式中没有了XML格式途径,我们正在开发针对该 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|3963 次阅读|1 个评论 热度 1
编织研究:研究合成未来的可视化
2020-2-27 17:33
Research Weaving: Visualizing the Future of Research Synthes 1:NakagawaS,SamarasingheG,HaddawayNR,WestgateMJ,O'DeaRE,NobleDWA, LagiszM.ResearchWeaving:VisualizingtheFuture&n ...
个人分类: 文献计量学|1188 次阅读|没有评论
新兴的科研整合网络的结构【译文】
2019-9-9 14:53
科学研究通常被认为是由追求学科进步的个人和小团队进行的。然而,作为一个整体,这种努力更像是一个由人、论文和思想整合而成的复杂体系。共同作者和引用网络的研究揭示了研究人员和文章的重要结构特征,但目前科学思想本身的结构尚不清楚。本研究认为主题网络可能是揭示概念关系本质的有用框架。使用这个框架,我们绘制 ...
个人分类: 生物医学文献计量学|1991 次阅读|没有评论
OntoPlot:大型本体中非层次关联的一种新型可视化(译文)
2019-9-8 10:34
本体是概念及其复杂关系的正式表示。它们被广泛用于捕获生物医学等领域的综合领域知识,其中大型复杂的本体可以包含数十万个概念。特别是由于本体体量较大,可视化对于创建、探索和理解其基础数据非常有用。现有的本体可视化工具通常关注于层次结构,对非层次关联的重视程度较低。在本文中,我们介绍了 OntoPlot ,这是 ...
个人分类: 本体|1479 次阅读|没有评论
从生物医学文献中自动识别出科学严谨临床研究报告的深度学习方法:比较分析研究
2019-2-27 15:45
背景: 开展循证医学实践中遇到的主要障碍是有效地找到关于特定临床主题的科学合理的研究。 目的: 探索采用深度学习方法从生物医学文献中检索科学合理的治疗研究。 方法: 我们使用 403,216 条 PubMed 记录作为噪声数据集,以标题和摘要作为特征训练卷积神经网络。将深度学习模型与目前 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|1893 次阅读|没有评论

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GMT+8, 2021-6-18 04:01

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