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生物医学文献中新趋势的预测[摘译]

2008-12-4 23:22

本文介绍一种利用基于文本数据来预测生物医学领域新出现的趋势的研究。其原理是 : 通过预测新增补到 MeSH 本体的主题词，来预测任意信息向真实知识的转化。本文也讨论了如何制备用于评价新趋势预测算法的数据集，该数据集是以 PubMed 摘要和相应的 MeSH 词作为基本材料的。结果表明对新趋势的早期预测 ...

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发现论文作者之间的协作水平，改善转化研究[摘译]

2008-11-20 06:14

摘要 转化研究就是将基础科学研究与患者治疗的改善结合起来的过程。从实质上讲， 这个过程需要广泛的技术和资源，一般不会在单个个体内发生。本研究调查了俄勒冈临床与转化研究所 (OCTRI) 发表论文的研究人员在协作上的特点，探索如何把不同专业的科学家结合起来促进转化性研究。 ...

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通过矩阵分解从生物医学文献中抽取未知的基因关系（翻译文摘）

2008-10-16 21:55

背景 构建出基于医学文献的基因相互作用网络是文本挖掘在生物信息学中最为重要的应用。从生物医学文献中抽取潜在的基因关系有助于建立生物医学假说，而假说可以通过实验进一步探索之。最近，基于奇异值分解（singular value decomposition）的潜在语义标引（latent semantic indexing）已经应用于基因检索上。然而， ...

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生物医学文本挖掘:概念识别

热度 1 2008-10-16 01:28

信息抽取是指在非结构化的自然语言文本中定位相应的结构化数据单元，从而使自由文本数据成为相应的结构化数据，它是文本挖掘的前期步骤和基础。 信息抽取的一个基本应用是识别文本中出现的概念，这是许多研究项目的基础。例如一个系统要在文献中确定基因与蛋白质的相 ...

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利用本体为基础的文本挖掘方法从MEDLINE文摘中抽取生物学关系抽取并应答查询

2008-10-14 02:14

生物学文本数据存储量的急剧增长使得造成了人类方便有效地获取所需信息上的困难。问题的出现是由于大多数信息都隐含在无结构或者半结构的文本中，这些文本计算机无法轻易地理解。 本文介绍了一个基于本体的生物学信息抽取与查询应答系统（ Biological Information Extraction and Query Answering ， BIEQA ）， ...

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MetaMap程序是如何把生物医学文本有效地匹配到一体化医学语言系统的超级词表的

2008-10-12 08:35

文摘 ：一体化医学语言系统（ UMLS ）是生物医学领域里面最大的词表，可以用在诸如年决策支持系统、病历管理、信息检索和数据挖掘之中。如何利用 UMLS 成为目前的重要话题。本文介绍了 MetaMap 程序是如何把生物医学的文本与 UMLS 中的超级词表（ MetaThesaurus ）相匹配，换言之，就是在生物医学 ...

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