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多维度多层次的聚类是发现关系的重要手段(2)
2011-7-2 15:23
最近看了一篇文章,忽然感到,技术又发展了,双聚类都不够了,又出现了多层次聚类了。下面翻译一篇论文的摘要,体会其中的奥妙吧。 Building the process-drug–side effect network to discover the relationship between biological Processes and side effects 建立过程与药物副作用 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|5859 次阅读|没有评论
多维度多层次的聚类是发现关系的重要手段(1)
热度 2 2011-7-2 15:12
传统的聚类是单维度的,称作单向聚类, 即只对行(对象)或者列(属性)进行聚类,不能对行和列同时进行聚类。如对高频的词或者高被引的论文根据它们共现或同被引聚类,只是把词或者论文进行了聚类。 双向聚类 (biclustering, 又称 subspace clustering, ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|11332 次阅读|2 个评论 热度 2
Medline数据库中相关记录的计算方法【节译】
热度 1 2011-2-15 10:50
我们将寻找相关文献的问题归纳为如下模型:给定某篇用户表示感兴趣的文献,系统的任务就是找到用户也会想要浏览( examine )的文献。因为这种活动往往发生在更为广泛的信息搜寻的行为之中,相关性可以作为感兴趣的指标,即,检索其他相关的文献。但是,我们用更宽泛的术语来描述这个问题:其他文献之所以成为感兴趣的 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|4303 次阅读|1 个评论 热度 1
生于忧患,死于安乐
热度 1 2010-11-10 12:54
【下面一段是我为某医学信息学期刊组织文本挖掘专栏时候写下的编者按,但是出于某种原因,该刊物没有发表这一段文字,看到很多人关注到了这个问题,就把它复制粘贴到这里吧】 今天,网络飞速发展,电子资源日益丰富,专业人员可以方便地在家免费利用信息资源。在这种形势下,说图书情报部门存在着生存危机,绝不 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|4718 次阅读|2 个评论 热度 1
不能用SPSS分析共现矩阵
热度 2 2010-5-26 11:39
共现分析中矩阵的种类:无论是同被引聚类分析,还是词共现聚类分析,都要把相应的矩阵输入到聚类分析软件中,比如SPSS,我们给软件输进去的是什么?多数的研究输入的都是共现矩阵,就是行和列都是相同的元素,比如高被引论文或者高频主题词: SMALL H, 1973 WHITE HD, 1981 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|24718 次阅读|7 个评论 热度 2
如何计算战略坐标
2010-4-16 11:04
:我们以一篇公开发表的论文中的矩阵作为例子,说明战略坐标的计算方法。数据来自于邱均平 等 关于共被引分析方法的再认识和再思考 情报学报 2008 27(1):69 74 数字是二者同被引次数,仅作为说明计算方法用,结果不具有实际意义。 此处对角线的数据是邱老师原文中按照共现最大次数+1计算的。 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|13581 次阅读|1 个评论
关于共现分析实际操作的通信
热度 3 2010-4-13 09:18
对共现分析感兴趣的人越来越多,这是我在94年开始做这方面研究的时候没有预料到的,这确实是值得庆幸的一件事情,但是随之而来的会有很多实际问题,尤其是对于初学者,这个问题不妥善解决,恐怕会影响到该方法的普及,所以,我觉得有义务给大家多做些解释说明,让这个方法能够得以平稳健康的发展。 以下是我与一位湖 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|11153 次阅读|7 个评论 热度 3
书目共现分析软件下载网址
热度 5 2010-3-16 16:40
已经把软件上传到 skydrive上去了,网址为: http://cid-3adcb3b569c0a509.skydrive.live.com/browse.aspx/BICOMB 对所有人公开,不需要登录到MSN。 共两个文件,选中其中一个,点击一下任一文件的图标,会转到下一个页面,两个文件的图标会移动到右方,然后选中其中的一个文件,点击左上角的下载,逐次 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|17234 次阅读|14 个评论 热度 5
BICOMB软件
热度 7 2010-3-5 16:45
多年来,我们在文献计量学研究和文本挖掘研究中迫切感到需要一个分析工具。根据我们多年来摸索并积累下来的经验,我们开发了这个软件。其实也是经历了10多年,各种不同版本的更新,但是, 需要郑重说明的是,这个小东西很不完善,相当不完善 。只是由于很多人跟我打听国外一些免费软件的使用方法,总是觉得解释别人的东 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|27086 次阅读|10 个评论 热度 7
共现分析目前需要解决的问题以及主观上的经验
热度 3 2010-2-20 11:35
共现分析越来越引起大家的兴趣,很多信息专业以外的研究人员也想利用这种方法分析自己学科领域的研究现状或者热点。因此,不断有人跟我探讨这个方法的具体使用问题,说实话,这个方法还在不断的完善之中,应用中有很多具体的问题还没有解决。所以,感觉应该把这个方法的一些弱点,或者说需要进一步完善的地方列举出来,同 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|7315 次阅读|4 个评论 热度 3

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