常用的Epigenomics(表观遗传学)数据

刘华 2012-9-27 17:56

DNA methylation : MeDIP和MRE是两种常用的技术，获得DNA甲基化数据； histone modification : CHIP-seq技术常用来获得组蛋白修饰数据，一般针对某一种修饰如H3K4me3,H3K4me1,H3K36me3,H3K9me3,H3K27me3等

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测序分析注意事项（一）--小心已知注释Refseq中的暗雷

热度 1 刘华 2012-9-25 14:08

我是参照 第20120723期集结号-转录组测序分析中cufflinks的使用及问题 和 如何将几个不同的基因组注释文件合并起来 的方法进行转录组分析， 但我用中间产生的的gtf文件上传到UCSC，提示错误“ Error File 'slim.norandom.gtf' - GFF/GTF group NM_009362 on chr17-, this line is on ...

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强烈推荐－SAS9.1.3中文全功能版软件下载

刘华 2012-9-24 19:11

强烈推荐－SAS9.1.3中文全功能版软件下载 SAS_9.1.3中文全功能版,文件比较大，请使用下载工具如迅雷等下载。我已经于今日安装测试过。能用。 下载地址： http://download.pinggu.org/sas/SAS9.1.3.iso 文件大小：1.85G 本软件仅做学习交流使用,请勿用于商业用途, ...

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鉴定某一基因功能的方法大全

刘华 2012-9-20 19:33

鉴定某一基因功能的方法大全 基因功能研究的策略与方法大体内容如下： 1. 新基因的生物信息学分析: 1.1 编码产物预测分析 1.2 序列同源性分析 1.3 蛋白质功能域分析 2. 新基因的体内表达规律分析 2.1 mRNA水平的表达谱分析 2. ...

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R语言多元分析系列之：主成分分析

刘华 2012-9-20 13:48

主成分分析 （principal components analysis， PCA）是一种分析、简化数据集的技术。它把原始数据变换到一个新的坐标系统中，使得任何数据投影的第一大方差在第一个坐标（称为第一主成分）上，第二大方差在第二个坐标（第二主成分）上，依次类推。主成分分析经常用减少数据集的维数，同时保持数据集的对方差贡献最大 ...

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生物信息学相关网站

刘华 2012-9-19 16:31

生物信息学与生物计算 ： http://bioinformatics.weizmann.ac.il/ 这是生物信息学和生物计算学的网站，由Weizmann科学研究所，生物服务部和Crown人类基因组学中心支持。研究领域主要涵盖序列分析，蛋白质组学和基因组学等。该网站提供了数据库，电子论坛，教育，新闻，软件，招聘启事等。该网 ...

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