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Bowtie2 做 Mapping 及抽取原始 paired-end 序列
鞠峰 2014-3-21 20:03
1.下载及安装 bowtie2; http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/index.shtml 2.格化式数据库(如contig序列文件); bowtie2-build contigs .fa assembly.bowtie 3.Map 原始序列至 contigs,结果输出为 SAM format; (1)Paired-end reads bowtie2 -x assembly.bowtie -1 Raw ...
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