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非root用户在linux服务器安装python package

已有 11198 次阅读 2015-6-3 11:38 |系统分类:科研笔记| Linux, Python, 服务器, CPAT

最近科研分析用到一个python 程序, CPAT (coding potential assessment tool), 需要在服务器上运行。由于该程序基于python 2.7(且仅基于),而服务器默认安装的python 为2.6。 作为一个非root用户,几经周折,终于搞定。步骤如下:


1. 自行安装python 版本2.7.0:

   1) 下载python-2.7.0.tar.gz

   2)  tar 解压文件

   3) cd 进入解压后文件: cd Python-2.7

   4) >./configure  生成makefile 文件

   5) >make  生成可执行python程序;(这里无法执行make install, 把python加入默认环境变量)

   6) 为以示区别, mv ./python ./python2.7;

   7) 修改 ~/.bash_profile 文件,把python加入当前用户环境变量:

      export PATH="$PATH:/home/XX/Software/Python-2.7/";

   8) 之后执行 python2.7即可启动该版本python.


2. 安装CPAT所需要的python 模块: numpy, cython;

   安装python包有多种方法:http://www.douban.com/group/topic/40892505/; 这里采用easy_install;

  1) 首先在用户目录下安装easy_install (https://pypi.python.org/pypi/setuptools ):

       wget https://bootstrap.pypa.io/ez_setup.py -O - | python2.7 - --user

      之后即可在~/.local/bin 中生成easy_install, 可直接运行;

      为了使之后安装的模块在自己目录下:

       a) 创建文件夹(若已存在,则不需创建):mkdir -p ~/.local/lib/python2.7/site-packages/

         b) 加入python环境变量(~/.bash_profile中添加):

           PYTHONPATH=$HOME/.local/lib/python2.7/site-packages;

           export PATH=$HOME/.local/bin:$PATH;


 2)安装numpy模块:

       easy_install  --prefix=~/.local   numpy

       即可自动下载相应版本numpy至site-packages,并安装;


3) 安装cython模块:

   easy_install  --prefix=~/.local   cython

   自动下载安装出现问题(cython-0.22); 选择其他版本安装(直接提供url链接)

   easy_install  --prefix=~/.local   cython https://pypi.python.org/packages/source/C/Cython/Cython-0.20.tar.gz#md5=104f3bcdeb4969ba426a37376b4c0e7f


4)下载安装CPAT1.2.1包;

由于是非常规python包,只能通过python setup.py安装:

python2.7 setup.py install --prefix=~/.local


5)大功告成。即可运行./CAPT/bin中的三个python文件,进行后续分析:

python2.7 cpat -help






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