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Perl代码| 读书随想| 论文阅读| 生物信息学| 方法总结| troubleshooting|
生物信息学问答论坛索引
李雷廷 2013-1-27 18:53
BioStar http://www.biostars.org/ 英文 SEQanswers http://seqanswers.com/ 英文 云生物 http://yunbio.com/ 中文 BioASK http://www.bioask.net/ 中文
个人分类: 生物信息学|3664 次阅读|没有评论
利用基因号从TAIR网站批量下载拟南芥基因序列的方法
李雷廷 2013-1-19 13:43
TAIR The Arabidopsis Information Resource http://www.arabidopsis.org/ 1 在TAIR主页，把鼠标放在工具栏“Tools”标签下，滑动鼠标至该标签弹出列表的“Bulk Data Retrieval”处，点击该标签，进入“Bulk Data Retrieval and Analysis”页面，网址： http://www.arabidopsis.org/tools/bulk/index.jsp 。 & ...
个人分类: 方法总结|30172 次阅读|没有评论
生物信息学之期刊分析
热度 2 李雷廷 2012-6-22 10:46
生物信息学之期刊分析
【前言：有意梳理目前生物信息学的期刊状况，因此整理成文，Leiting, Jun 17, 2012】 生物信息学领域的学术期刊，目前有 5 份名字中带有 Bioinformatics（筛选自SCI期刊目录）。这 5 份期刊影响因子最高的是 Briefings in Bioinformatics，为9.283，但是年发文量太少，只有 14 篇，有虚高的嫌疑。生物信息学领域的主力 ...
个人分类: 生物信息学|16045 次阅读|2 个评论 热度 2
科学网博文索引：生物信息学
热度 2 李雷廷 2012-6-17 15:15
【前言：整理科学网上关于生物信息学的博文，把这一主题相关的博文链接贴在这里，方便阅读研究，并会不断搜集整理更新，Leiting, June 17, 2012】 1 综合篇 2012.09.19，牛登科， 生物信息学，可以安于非主流，而且应该庆幸非主流 2012.09.19，吕强， 生物信息学不需要裸奔 2012.09.18，薛宇， 上 ...
个人分类: 生物信息学|5370 次阅读|2 个评论 热度 2
Perl代码实例之词频统计软件word_freq
热度 2 李雷廷 2012-4-26 13:55
今天在读《Shell 脚本学习指南》 时得到启发，很有兴趣写一个词频统计的软件。因此就花了几个小时用Perl语言写了一个100多行代码的软件。word_freq以自由软件 、开放源代码 的形式发布在此。文后附有源代码。 一、运行环境 1 perl 软件是由 Perl 写成，因此运行软件前，电脑上必须有 perl 解释器 , 可以在这 ...
个人分类: Perl代码|8663 次阅读|3 个评论 热度 2
Perl代码实例分析之从下载序列·一
热度 1 李雷廷 2012-4-26 13:25
从网 络 上下 载 DNA ， mRNA 或 protein 序列，是分子生物学和生物信息学的基本功。最 简单 的下 载 序列的方式莫 过 于直接从 NCBI ( http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ) 检 索到序列，然后通 过 网 页 上的 Send to 选项下载之。本文的目的是通过对一例序列下载 Perl 语言代码来简要介 ...
个人分类: Perl代码|7077 次阅读|1 个评论 热度 1
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