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- 置顶 · bioconda中国镜像(清华，中科大腾讯源均已失效)
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- bioconda是conda上一个分发生物信息软件的频道，现在已经有超过2700款软件。由于国内没有基镜像，下载安装生物信息软件速度十分缓慢，经常中断，生物信息人迫切需要一个国内镜像。Bioconda is a channel for the conda package manager specializing in bioinformatics software。 201 ...
- MOTHUR学习笔记
- 最近有点好奇，仅次于qiime的Mothur，用起来感觉如何，于是决定尝试下。虽然qiime还没有学会学透，但人活着就要折腾嘛，否则与咸鱼有什么区别，哈哈。 1.下载地址 Github项目地址– https://github.com/mothur/mothur 软件下载地址： https://github.com/mothur/mothur/releases/download/v1.40.5/Mothur.win_64.zi ...
- SNP2HLA学习笔记2
- HLA基因，位于6号染色体上短臂上，长约4000Kb。HLA是目前所知人体最复杂的遗传多态性系统，有几十个基因座位，每个基因座位又有几十个等位基因，且呈共显性表达。由于MHC基因位于同一条染色体上，其多基因座位上的基因型组合相对稳定，很少发生同源染色体间交换，这就构成了以单元型（HAPLOTYPE，即在同一条染色 ...
- 树莓派充当远程下载机笔记
- 手头上有一台树莓派3b，一直没怎么使用，除了做点下载用，但是基于不能远程控制，花生壳内网穿透用着还不错，但是免费版本只能用两个端口，完全不够用啊，于是想自己搞一个。正好，手头有一台google云服务器，一年免费试用版，充一美元使用最低配置一年，相当划算，而且，不会像亚马逊一样乱扣费，所说用于机器学 ...
- 肠道菌群学习笔记
- 一、乳酸菌 是指发酵糖类主要产物为乳酸的一类无芽孢、革兰氏染色阳性细菌的总称。它 不是一个分类学上的概念 ，至少包含5种23属，其具有种和菌株的决定性，21种可用于食品和保健品的生产（6种 双歧杆菌 、14种 乳杆菌 、1种 链球菌 ），只有6种可用于婴幼儿。 附名单： https://wenku.baidu.com/view/20e6c ...
- 几个肠道微生物检测方法的对比
- 由安吉莉娜·茱莉助推的基因检测仍在持续火热，蓝海逐步成为红海。而早就有人把目光投向了肠道微生物群的检测，最近一段时间ncs的接力发表足以说明它的火热，检测公司国外有ubiome等，国内也有多家公司进行这个检测。下面，我们来管中窥豹，看看几个检测方法的比较，只说我用搜索引擎找到的公司，无任何偏好性。 ...
- Q2STUDIO学习笔记三
- 1.Feature表统计 继续我的qiime2图形界面q2studio学习笔记，之前已经获得了featuretable，现在对这个表做个统计。依旧是很简单的，选择featuretable–visualization-summarize table，这里是需要实验设计文件（metadata）的，最好放上，这里我就不放了。点run之后，很快就有结果了。 结果就像教程里的那样 ...
- QIIME2图形界面学习笔记二
- 在装好了q2studio后很困惑，所有的插件都是灰色的，即使切换到有数据的文件夹，一直以为是我的报错（$JAVA_HOME找不到）导致的。由于报错，我还尝试了好几个版本进行测试，可是悲剧的是都有问题，于是祭出杀手锏，上虚拟机了哈哈。比conda还要简单，当然性能也就相对差点了。先运行起来学会再说。于是尝试先试试官 ...
- 小说爬虫小试
- 好长时间没有使用自己蹩脚的技术写个小爬虫做点事情了，刚好，发现一个小说网站，当然，我对小说内容没有兴趣，只是随便找了本小说，爬爬测试。 下面是我的爬虫逻辑，首先，从目录页获得每个章的地址，这个在 http://www.jmrgs.com/showinfo-121-65372-0.html#001 这个网页上，可以通过beautifulsoup解析网页中的 ...
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