博文

置顶 · bioconda中国镜像(清华，中科大腾讯源均已失效)

隐藏 2017-9-21 13:04

bioconda是conda上一个分发生物信息软件的频道，现在已经有超过2700款软件。由于国内没有基镜像，下载安装生物信息软件速度十分缓慢，经常中断，生物信息人迫切需要一个国内镜像。Bioconda is a channel for the conda package manager specializing in bioinformatics software。 201 ...

10581 次阅读|没有评论

circos学习笔记（一）

2017-10-11 12:49

在我的腾讯微云里找到了一个上研究生阶段细菌基因组的测序拼接结果，想画个圈图玩玩，于是找到了circos(基因组圈图的绘制),发现还总是把它与cytoscape(网络可视化)混了，也是醉了，本来以为是一个的，原来是不同的，一个是用perl写的（前者），后者是用java的。 下面，说一下我的安装过程，就是普通的perl，模块安装， ...

9335 次阅读|没有评论

基因检测的作用

热度 1 2017-10-9 16:04

好多亲友问我的工作，我给他们讲基因检测的意义，总是讲不全，今天整理一下：基因检测作用 1.可以评估你的疾病易感性，通俗点说就是容易得什么病，对什么病有较强抵抗力。 2.可以分析出你有没有携带遗传病的致病基因，对于没有发病的提早预防，对于携带的做好下一代的优生优育。 3.可以评估你的药物代谢能力，这 ...

2453 次阅读|2 个评论 热度 1

爬虫小试-0217影响因子表

2017-10-9 15:54

题目来源于生信技能树论坛，参考了几个帖子。 http://www.biotrainee.com/thread-1695-1-1.html http://www.biotrainee.com/thread-1316-1-1.html 比如这个最简单的，表格爬取： http://www.letpub.com.cn/index.p … r=¤tpage=1000 http://www.letpub.com.cn/index.p … tter=¤tpage=3 http://www.letpub.com.cn/ ...

2786 次阅读|没有评论

史上最全，各个平台测序仪比较

2017-9-25 16:23

部分数据来源于公众号 陈巍学基因，整理而成。数据可能过时，仅供参考。 我决定简单粗暴的上图片。 http://www.zd200572.com/2017/09/25/sequencer_comparation/

3086 次阅读|没有评论

2017书单3

2017-8-28 12:38

30.围城 钱钟书的一部经典文学作品，只在高中刚开学的时候读过一点，听当时的老帅、班主任王家友讲过一点。王老师的音容笑貌依然在心呀！话说这本书，写的是出国留洋的方鸿进，买了野鸡大学的假文凭后的一系列遭遇，也经历了一系列变故，从由于追其表妹唐婉如不小心错过苏文纨开始，而后又到三闾大学任教，由于没有文凭导 ...

2033 次阅读|没有评论

中国健康、医疗大数据中心盘点（持续更新）

2017-8-25 09:10

目前，全国已有超过20个省市申请健康医疗大数据中心及产业园国家试点工程，国内外知名企业也纷纷要求加入。在国家卫生计生委指导下，组建以国有资本为主体的三大健康医疗大数据集团公司，承担国家健康医疗大数据中心、区域中心、应用发展中心和产业园建设等国家试点工程任务。建设一个国家数据中心，加七个区域中心，并结 ...

5738 次阅读|没有评论

中国科大开源镜像站的bioconda新镜像申请

2017-8-2 15:49

我在中国科大开源镜像站的github上提交了bioconda新镜像申请，现在处于投票阶段，大家快去投票。地址在这： https://github.com/ustclug/mirrorrequest/issues/125 请在 Github Issue 页面使用 Emoji 表情来投票。 请参考 这里 的使用说明。 还有管理员说 没有找到可靠的同步方法。 希望能由bio ...

个人分类: IT|2567 次阅读|1 个评论

本页有 3 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏