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DigitalMicrograph Demo版的使用

已有 25204 次阅读 2013-7-3 07:38 |个人分类:电镜软件|系统分类:科研笔记| Demo, DigitalMicrograph

这个最早的DM demo版本帮不少朋友解决了软件问题。虽然现在已经多数开始用完整版,我前面也提到Gatan主页很Nice的提供下载Free license的Win7版的GMS2.0,而且功能齐全。不过这个版本的一些使用方法还是保留在自己的博客里吧,备查。

ps:有朋友问我这些博客是否是转帖,这个可以保证是原创,虽然有的图的确是从其他网站从本人的帖子里“转帖”的,但图片的版权肯定是属于本人的,也有几个帖子也经过修正和编辑,特此声明一下。

 

用过Gatan公司的CCD相机的朋友应该都接触过DigitalMicrograph(下面简称DM)这个专用的电镜软件,一般用这类相机记录的照片都建议存为dm3的默认格式,这样能最大程度的保存照片的信息,对于后续处理很有益处。
但由于DM这个软件不是免费的,所以很多使用者为了使用方便,最后总是要转换成JPEG或者TIFF格式,这就对测量、做FFT、做像处理和其他相关操作带来了不便。Gatan公司注意到这点,并希望有更多的人能为这个软件的功能开发做出贡献,放了一个Demo版的软件在自己的主页上,这个版本就是网上流行的DM demo版。不过现在已经有了完整版,请点击下面的链接即可。没必要去下这个了:
http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=1116111&fpage=1

这个demo版解压缩即可使用,版本号如下:


这个软件的基本功能,其实Gatan公司在2005年的一次讲习班上已经有了比较详细的论述,具体内容可以到网上去搜:

http://wenku.baidu.com/view/583d4a160b4e767f5acfce74.html

也可以找到DM 3.4版的user manual:

http://emuch.net/html/201109/3127772.html

我这里就不详细论述,单就版友经常问的几个基本问题说一下我的做法,如果有人有更好的办法,请不吝赐教,俺也好学习学习。


1. 这个版本的基础功能基本都有,就是不能直接存文件或者转存为其他文件格式。
这个倒是好解决,打开一个dm3的文件,鼠标点中图片,点右键选copy这个选项,而后paste到powerpoint(2003版以上)的空白文件里(或者photoshop里面),而后在powerpoint的文件里,同样点选鼠标右键,选“另存为图片”,这个时候就可以调整图片大小并存为其他格式,比如JPEG,TIFF等等。



另外,注意在copy之前,最好用右边“standard tools”里面的放大镜点击图片,放大之后不要点最大化按钮,这时再copy,就能保证尽量大的像素。关于这个问题,这个帖子,里有详细论述:
http://www.instrument.com.cn/bbs/shtml/20080524/1274229/
还要注意的一点是:copy时要把scale bar(标尺)完全露出来,否则有可能会在paste到其他软件后失去原标尺的数字。

2. 上面说过,很多人手头可能没有dm3格式的文件,那么用demo版的DM如何去做图像的测量等操作呢?我这里用一张介孔材料的JPEG图片为例做一下图示:
a) 用DM demo软件打开图片:



b) 用放大镜工具对标尺部位放大两次,并拖动到图片中央:



c) 用ROI tools里面的虚线对准标尺,拉出同样长度的一条虚线:



d) 点选菜单Analysis下面的calibrate,这个时候会出现一个对话框,选nm,并填写50(根据原图片标尺变化),点击Ok后,这个图片就有了自己的标尺。



另外,如果你要标定的是衍射花样,那么就是拉已知d值的衍射点到中心斑,同样操作,但最后的单位选1/nm,填写的数字是所拉线段对应的长度(nm),比如5 1/nm,其长度对应于1/5 (1/nm)=0.2 nm,选择OK,就校正完毕,在Edit菜单里面添加标尺,这样就能看到倒易空间的标尺了

e) 这个时候再去量任意两点之间的距离,就不是一个数字,而是有了nm的单位,注意control对话框的L的数值和单位(如果没有看到control对话框,那么到菜单window-floating windows里面点击show all):

 

3. 虽然有了标尺,这个图片可能还无法做FFT,这就需要对图片的数据格式进行修改:在菜单Edit里面有一个change data type的选项,点选之后会出现如下对话框:



如果开始的格式是RGB或者其他格式,那么改成Integer,bytes选4即可,不论问什么一律确认。这时再点选ROI tools里的虚框,按下Alt键的同时拉一个正方形的范围,再点菜单Process里的FFT,结果出来了:



这个FFT的花样和衍射一致,拉虚线测量,看control的L结果已经是1/nm这个单位,接下来的工作就和衍射花样的标定一样了。

这个FFT花样也同样能做像滤波处理,具体可以参看这个帖子:
http://www.instrument.com.cn/bbs/shtml/20051219/304863/

 



https://wap.sciencenet.cn/blog-609600-704762.html

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