西交大霍有光教授在回复中说：

“原光明日报副主编郑北鹰先生在《光明日报》发表的《直面旱魃》（2000-6-16）一文透露说‘据水利部南水北调规划设计管理局局长张国良说，南水北调工程实施后，长江水流到北京，按现行不变成本计算，每立方米水将达20元以上。’显然这个价格指的是直接调水价格，不包括水处理价格。”
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这种似是而非说法是误导人的。我们必须厘清投资与成本，工程投资不能直接计入成本，计入成本的只能是折旧。因为任何水利工程的使用寿命不可能只有一年，我们也不可能要求任何工程建设项目一年内能收回全部投资。
如果按工程投资计算，单方入京水分担的投资可能接近20元，但问题是南水北调工程折旧期不可能只有一年，工程可能用30年、50年甚至更长时间，因此，每方水分担的年均折旧可能就是一元多，加之维护和运行费用，南水到北京的口门价格可能在每立方2元左右，加上自来水管网的成本，用水户水龙头的水价每方可能4-5元。

南水北调中线一期工程静态总投资920亿元（包括工程建设投资、水库淹没及工程占地处理投资、环境保护及水土保持投资）。南水北调东线第一、二、三期主体工程共计投资420亿元，治污投资240亿元。以上投资合计为1580亿元。当时是按2002年的物价计算的，后来物价增加（主要是移民成本）。09年时东线工程、中线一期工程又追加500亿元的投资，那么工程投资总额约为2080亿元，约相当于三峡工程。
中线以期工程调水约每年95立方米，大约为汉江总水量的1/7，建设汉江下游补充工程后可增至150亿立方米，甚至更多，约相当于汉江总水量的30%。东线1、2、3期合计调水约180亿立方米（大部分用于苏北灌溉），合计2080亿投资可以调水275亿立方米，平均每立方米投资不足8元。当然北京位于调水路线的最末端，成本会高一些，所以说每立方米进京南水分摊的成本达到20元也算是基本不离谱的。
但是没有谁会要求南水北调工程的投资收回期是1年，工程折旧年限至少是20-30年，而且南水北调工程的使用寿命绝不止三五十年，那么真实费用更低。每方进京南水分担的年均折旧，可能就是一元多，加之维护和运行费用，南水到北京的口门价格可能在每立方2元左右，加上自来水管网的成本，用水户水龙头的成本每方可能4-5元。而且北京开采深层地下水做自来水源的成本也不低，还会越来越高，因为地下水位还在下降。

只要是客观的评价，与南水北调相比，海水淡化成本更高，能耗也更大。海水淡化主要有两种途径，蒸馏法和反渗透膜法。
根据淡化程度的不同，可以得到微咸水直到近乎纯净的蒸馏水。当然，淡化程度越高效率越低，消耗的能源也越多。微咸水可以做对水质要求不高的冷却、冲渣等工业用水和氯碱化工的原料。因此，火电、钢铁、化工等企业都可以大规模临海布局，这样的话就可以节约大量宝贵的耕地和淡水资源。这些工厂释放的余热还可以用作大规模淡化海水的能源。但是按目前成熟的技术、大规模工厂化生产的成本也比绝大多数城市从水龙头中流出来的价格高。因为海水淡化需要消耗大量的能源。中国不是沙特、不是科威特，也不是阿联酋，他们有用不完的石油来淡化海水，中国没有。
多级淡化的海水实际上是去离子水（软水），甚至比蒸馏水还要纯净。如果把这些水注入到自来水供水管网，将会被“污染”，使用软水的工厂，还要对其再净化，会造成浪费。因此多级淡化的海水可直接供工商业使用，用作锅炉水，中央空调系统循环水，或用于需要用纯净水进行生产的芯片制造厂、制药厂。若想从海水中得到淡水就必须克服25 个大气压的渗透压， 相当于260米高水柱，这已是南水北调东线提水高程的将近4倍，而中线可以全程自流引水。
海水多级淡化耗能较大，因此成本也较高，达到每方3-4元，超出了一般城市的自来水价，这还是海水淡化工厂出厂价，或者说是海水淡化厂向自来水公司供水的价格，到居民水龙头的水价将远高出这一水平。如果是向内陆城市供水，比如由天津塘沽向北京供水，由于要兴建输水管道和提水费用，成本将增加更多。
当然，即使每方30-40元的水价也比瓶装水低许多，如果建立了淡化海水的输水管网体系，每个城市都可以罐装瓶装的纯净水，假使人们的习惯和接受能力没问题的话，倒是可行的。但是用于洗衣、洗菜、洗澡、做饭等日常生活未免就有些暴殄天物了，毕竟海水淡化要消耗大量的能源。