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癌症分子亚型的现状及临床应用趋势
张俊鹏 2023-3-10 07:15
癌症分子亚型的现状及临床应用趋势 癌症是一大类遗传疾病,目前主要按其起源部位分类,如脑癌、乳腺癌和肺癌。然而,并非所有器官的癌症都是相同的,癌症之间和癌症内部存在遗传异质性。造成这种异质性的一个主要原因是基因组的不稳定性,它可以在单核苷酸水平上起作用,或者在更大的尺度上起作用。这对目前 ...
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利用药物转录组图谱探索中药药理活性成分平台:ITCM
热度 1 张俊鹏 2023-3-8 21:27
利用药物转录组图谱探索中药药理活性成分平台: ITCM 中医被认为是药物发现的丰富来源,在预防和治疗各种疾病,如免疫系统疾病、心血管疾病、癌症和 COVID-19 等极其复杂的疾病方面表现出极好的潜力。许多中药衍生药物在治疗疾病方面效果显著,如青蒿素、葛根素、伊草素等。 2015 年,一种以青蒿素为 ...
个人分类: 科普|1792 次阅读|2 个评论 热度 1
免疫信号通路关联的调控子数据库:ImmReg
张俊鹏 2023-3-6 15:10
免疫信号通路关联的调控子数据库: ImmReg 免疫系统失调已被发现是癌症发展的主要原因。免疫治疗已经成为一种有前途的癌症治疗策略。免疫相关基因表达失调的基础知识对于产生强大的免疫至关重要,并为癌症免疫治疗提供了新的见解。许多机制有助于基因表达调控,并确保转录对外部信号的响应。通过定量和计算分析, ...
个人分类: 科普|1167 次阅读|没有评论
定向分化的转录因子图谱
张俊鹏 2023-3-3 09:54
定向分化的转录因子图谱 全面了解基因调控网络 (GRN) 控制细胞状态是分子生物学的基本目标。转录因子 (Transcription factor , TF) 结合到基因组中的特定序列,以改变基因表达和指定细胞状态。单个 TF 的过表达可以导致细胞命运的深刻变化。例如,单个 TF 已被证明可以引导多功能干细胞向许多不 ...
个人分类: 科普|1038 次阅读|没有评论
值得关注的宝藏数据库:CNCB-NGDC
张俊鹏 2023-3-1 09:30
值得关注的宝藏数据库: CNCB-NGDC 国家基因组学数据中心 (NGDC) 是中国国家生物信息中心 (CNCB) 的一部分,为全球学术界和工业界提供一系列数据库资源。随着多组学数据以前所未有的速度爆发式积累, CNCB-NGDC (图 1 )通过大数据归档、整合分析和增值策展,不断扩展和更新核心数据库资源。在 ...
个人分类: 科普|1385 次阅读|没有评论
基于生物病理轨迹的癌症驱动子识别因果方法
张俊鹏 2023-2-27 13:08
基于生物病理轨迹的癌症驱动子识别因果方法 普遍认为,具有驱动突变的基因是癌症的驱动子。最近的研究结果表明,一些没有驱动突变的基因也会导致癌症进展。驱动导致癌症的生物过程的基因 ( 即动态癌症驱动因子,简称 DCD) 不一定是突变的。此外,不同的生物核心过程是由不同的基因集驱动的。不同类别癌 ...
个人分类: 科普|908 次阅读|没有评论
非编码RNA与免疫关系数据库:RNA2Immune
张俊鹏 2023-2-25 09:06
非编码 RNA 与免疫关系数据库: RNA2Immune 非编码 RNAs(ncRNAs) ,如 microRNAs (miRNAs) 、长链非编码 RNAs (lncRNAs) 和环状 RNAs (circRNAs) ,已成为免疫系统的重要调节因子,参与控制免疫细胞生物学、疾病发病机制以及疫苗反应。 ncRNA- 免疫关联数据库将促进我们对免疫系统中 nc ...
个人分类: 科普|869 次阅读|没有评论
因果涌现普遍存在于各种因果关系测量中
张俊鹏 2023-2-23 14:05
因果涌现普遍存在于各种因果关系测量中 因果涌现理论认为:宏观尺度可以减少因果关系中的噪声,从而在宏观尺度上产生更强的因果。首先是使用有效信息,后来是模型系统中的集成信息,从那时起,因果涌现就在各个科学领域的真实数据中进行了分析。但这仅仅是这些原始措施的一个怪癖吗 ? 为了回答这个问题, ...
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滴水不漏
张俊鹏 2023-2-20 09:50
滴水不漏 《朱子语类 · 易三》中,滴水不漏( Watertight )的字面意思是一滴水也不外漏。形容人说话、办事非常细致、周密和无懈可击,也形容人将钱财全部抓在手里,不肯轻易出手(参见 https://baike.baidu.com/item/ 滴水不漏 /1153997 )。在社会生活(做人和做事)中,我们对滴水不漏的字面意 ...
个人分类: 科普|1149 次阅读|没有评论
技术和计算进步推动高通量肿瘤学发展
热度 1 张俊鹏 2023-2-17 11:47
技术和计算进步推动高通量肿瘤学发展 工程和计算的进步为癌症研究开辟了许多新途径,特别是在跨学科应用方面。例如,微流体、新型测序技术和计算分析的结合对于实现单细胞分析至关重要,例如首次给出了肿瘤异质性的详细图像。以类似的方式,这些“技术”学科生成大型数据集,已经成为多维癌症“组学”方法、 ...
个人分类: 科普|1015 次阅读|2 个评论 热度 1

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