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单细胞多组学时代的基因调控网络推理: 张俊鹏 2023-8-2 08:42; 单细胞多组学时代的基因调控网络推理细胞调节基因转录以协调细胞对细胞内和细胞外信号的反应。转录在很大程度上受转录因子（ TF ）的调节，转录因子是一种与 DNA 的特定序列（ DNA 结合位点）结合的蛋白质，可以对靶基因的转录率产生积极或消极的影响。基因组 DNA 与结构蛋白紧密堆积在核小体复合 ...; 个人分类: 科普|507 次阅读|没有评论

癌症定义的更新版本: 张俊鹏 2023-7-31 07:57; 癌症定义的更新版本癌症的大多数定义大体上符合 NCI 目前的定义： “ 癌症是一种疾病，其中身体的一些细胞无法控制地生长并扩散到身体的其他部位 ” （见表 1 ）。这些定义倾向于描述癌症 “ 看起来 ” 或 “ 做了什么 ” ，但没有描述癌症 “ 是 ” 或 “ 已经成为 ” 什么。虽然 ...; 个人分类: 科普|477 次阅读|没有评论

非编码RNA在人类癌症中的新作用: 张俊鹏 2023-7-28 09:01; 非编码 RNA 在人类癌症中的新作用人体中的蛋白质是通过 RNA 的转录和翻译获得的，但研究表明，人体中只有 2-3% 的基因可以编码蛋白质。其余的是不编码蛋白质的 ncRNA ，科学家曾认为 ncRNA “ 无用 ” 。自从 20 多年前在隐杆线虫中发现 lin-4 和 let-7 以来，对 ncRNA 的研究 ...; 个人分类: 科普|501 次阅读|没有评论

miRNA生物信息学在线工具分析: 张俊鹏 2023-7-26 09:27; miRNA 生物信息学在线工具分析我们对 miRNA 及其生物学作用的大部分理解源于实验发现，这些发现有助于 miRNA 研究领域的进步。然而，尽管近几十年来进行了广泛的研究，但仍然非常需要更多地了解现有 miRNA 的总数及其在调节途径中的全部影响。近年来，生物信息学工具的数量不断增加，有助于满足该 ...; 个人分类: 科普|591 次阅读|没有评论

TCMBank：最大中医数据库提供基于深度学习的中西医互斥预测: 张俊鹏 2023-7-24 09:27; TCMBank ：最大中医数据库提供基于深度学习的中西医互斥预测在中药现代化中，两个关键方面是确定中药中的有效成分和阐明有效成分与靶标之间的作用机制。构建一个全面、高可靠性的中医药数据库是非常可取的。自 2011 年成立以来， TCM 数据库利用自然语言处理，建立了知识图谱和分子信号 ...; 个人分类: 科普|628 次阅读|没有评论

生物绘图工具：BioRender: 热度 1 张俊鹏 2023-7-21 07:08; 生物绘图工具： BioRender BioRender （图 1 ， https://www.biorender.com/ ）是世界上第一个帮助科学家创建和分享美丽、专业的科学图形的工具。虽然是商业性工具（价钱适中），但是对于绘制生物机制图来说还是很方便的。最重要的一点， BioRender 提供了生命科学领域 5000 多个图标和常用的分 ...; 个人分类: 科普|933 次阅读|2 个评论热度 1

非编码RNA富集分析工具：RNAenrich: 张俊鹏 2023-7-19 12:14; 非编码 RNA 富集分析工具： RNAenrich 在过去的 25 年里，非编码 RNA(ncRNAs) 引领了生物医学和生命科学研究的流行趋势，对 ncRNAs 及其相关领域的兴趣不断扩大。随着对 ncRNA 研究的不断深入，几种调节性 ncRNA ，包括 microRNA (miRNA) 、长链非编码 RNA (lncRNA) 、环状 RNA ( ...; 个人分类: 科普|754 次阅读|没有评论

首个全面的耐药性信息景观：DRESIS: 张俊鹏 2023-7-17 08:59; 首个全面的耐药性信息景观： DRESIS 广泛的耐药性已成为地方 / 全球卫生保健的一个关键问题，因此，地方政府和世界卫生组织为了解决这一关键问题，已经投入了大量的努力来发现新的化合物 ( 如变构调节剂 ) ，提出有效的药物组合和开发新的生物技术 ( 如 PROTAC) ，有效地克服相应的耐药性。众 ...; 个人分类: 科普|519 次阅读|没有评论

生物信息资源平台：bio.tools: 张俊鹏 2023-7-12 09:18; 生物信息资源平台： bio.tools 生命科学在很大程度上依赖于高通量技术来理解，例如，基因结构、表达、调节和变异对人类健康、福祉和环境的功能影响。其结果是前所未有的大量复杂的、高度异质的生物信息，这些信息可能跨越多个科学学科，如遗传学、生态学和农业。为此，开发了许多软件工具和数据库来管理 ...; 个人分类: 科普|513 次阅读|没有评论

基因组、药物基因组和免疫基因组水平基因集癌症分析平台：GSCA: 张俊鹏 2023-7-10 12:15; 基因组、药物基因组和免疫基因组水平基因集癌症分析平台： GSCA 癌症是一种多种基因或通路发生改变的复杂疾病。因此，开发基于多组学数据的平台对癌症研究中的关键基因和通路进行基因集分析 (GSA) 是至关重要的，因为基因集是一组在特定生物学通路或条件下具有相似功能或共调控或共表达的基因。 GSA ...; 个人分类: 科普|584 次阅读|没有评论

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