科学网—zhangjunpeng的博文 - 第11页

设为首页收藏本站

开启辅助访问切换到宽版

科学网 › 我的中心 › 博文 › zhangjunpeng的博文

zhangjunpeng

https://wap.sciencenet.cn/?571917

征稿| 科普| 招聘| 教学| 读书|

EMT基因调控数据库：EMT-Regulome: 张俊鹏 2022-12-24 17:26; EMT 基因调控数据库： EMT-Regulome 在前两次，分别介绍了 EMT 标记物数据库 EMTome 和 EMT 基因数据库 dbEMT （分别参见 EMT 标记物数据库： EMTome 和 EMT 基因数据库： dbEMT ）。以往研究表明， EMT 受多个基因调控。那么， EMT 相关的基因调控关系、基元（ motifs ...; 个人分类: 科普|1513 次阅读|没有评论

EMT基因数据库：dbEMT: 张俊鹏 2022-12-19 18:25; EMT 基因数据库： dbEMT 在上次，已经介绍了 EMT （ Epithelial-Mesenchymal Transition ）标记物数据库（参见 EMT 标记物数据库： EMTome ），本次介绍一个比较早的与 EMT 相关的基因数据库 dbEMT （图 1 ， http://dbemt.bioinfo-minzhao.org/index.html ），已经更新 ...; 个人分类: 科普|1952 次阅读|没有评论

EMT标记物数据库：EMTome: 张俊鹏 2022-12-15 10:07; EMT 标记物数据库： EMTome EMT （ Epithelial-Mesenchymal Transition ）为上皮细胞 - 间充质细胞转换生物过程，该生物过程与恶性肿瘤的发生、发展和恶化紧密相关。在前面的文章中，已经知道 miRNA 也参与 EMT 过程（参见 miRNA 与 EMT ）以及介绍了调控 EMT 过程的许多调控因子 ...; 个人分类: 科普|1735 次阅读|没有评论

单细胞数据中数据特异性差异表达基因识别: 张俊鹏 2022-12-12 08:56; 单细胞数据中数据特异性差异表达基因识别基因差异表达分析是转录组等数据分析中非常常规的手段之一，其重要意义在于能够帮助理解所要研究的生物学问题。本质上，基因差异表达分析也是一种预处理（降维）方法。尤其是在处理样本少、变量多（即多 n 少 p 问题）的数据时，基因差异表达分析能够化繁 ...; 个人分类: 科普|1475 次阅读|没有评论

人类细胞互作数据库：CITEdb: 张俊鹏 2022-12-5 09:11; 人类细胞互作数据库： CITEdb 细胞是多细胞生物的基本单元，它们相互协作共同实现生物的生理功能。细胞互作或通讯的研究将扩宽和加深理解细胞的运作模式。关于细胞互作或通讯，在前面已经对其基本概念（参见生物组织内细胞通讯）和一体化的推理框架（参见细胞通讯推理框架）进行了介绍。本 ...; 个人分类: 科普|1145 次阅读|没有评论

miRNA靶基因预测工具：“我们到了哪里，又该往哪去？”: 张俊鹏 2022-11-28 09:21; miRNA 靶基因预测工具： “ 我们到了哪里，又该往哪去？ ” 关于 miRNA 靶基因识别，本公众号已经推荐了许多工具、方法和数据库，感兴趣的可以在公众号里面搜索“ miRNA ”。本次为大家推荐一个有关 miRNA 靶基因预测工具的综述文献（图 1 ），里面的思路挺有意思的，可以借鉴到其他 ...; 个人分类: 科普|1355 次阅读|没有评论

细胞发育轨迹数据库CellTracer: 张俊鹏 2022-11-21 09:42; 细胞发育轨迹数据库 CellTracer 在单细胞层面，生物标志物的应用之一是细胞注释（ cell type annotation ）。生物标志物之所能够进行细胞注释，其前提条件是不同细胞类型内，生物标志物的表达（例如基因表达）具有差异。这种差异使得细胞群体分为许多细胞亚型。在单细胞研究领域，细胞注释是下游分析 ...; 个人分类: 科普|1580 次阅读|没有评论

细胞标志物数据库CellMarker 2.0: 张俊鹏 2022-11-14 21:40; 细胞标志物数据库 CellMarker 2.0 关于生物标志物，上两次分别对其定义和应用（参见生物标志物定义及其应用），以及分子生物学数据库 MarkerDB （参见分子生物标志物数据库 MarkerDB ）进行了介绍。在细胞层次，本次介绍一个细胞标志物数据库 CellMarker 2.0 （图 1 ）。 &nb ...; 个人分类: 科普|2667 次阅读|没有评论

分子生物标志物数据库MarkerDB: 张俊鹏 2022-11-7 11:13; 分子生物标志物数据库 MarkerDB 生物标志物是生物学的路标，其作用等同于道路指示牌告诉驾驶员前方路发生了什么。在上次，已经介绍了生物标志物的定义及其应用（参见生物标志物定义及其应用）。本次说一下开源的分子生物标志物数据库 MarkerDB （ https://markerdb.ca/ ）。 Ma ...; 个人分类: 科普|1886 次阅读|没有评论

生物标志物定义及其应用: 张俊鹏 2022-10-31 10:08; 生物标志物定义及其应用生物标志物（ Biomarkers ）对于有效发展医学治疗至关重要，然而在研究和临床实践中，其基本定义和概念仍然存在混淆。澄清不同生物标志物的定义以及更好理解其应用将对医学治疗具有重要意义。什么是生物标志物？传统的简单并且模糊的定义为“ A defined characte ...; 个人分类: 科普|2892 次阅读|没有评论

1 ... 7 8 9 101112 13 14 15 ... 25 下一页

会议

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2023-10-2 10:16

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部