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- 生物绘图工具：BioRender
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- 生物绘图工具： BioRender BioRender （图 1 ， https://www.biorender.com/ ）是世界上第一个帮助科学家创建和分享美丽、专业的科学图形的工具。虽然是商业性工具（价钱适中），但是对于绘制生物机制图来说还是很方便的。最重要的一点， BioRender 提供了生命科学领域 5000 多个图标和常用的分 ...
- 非编码RNA富集分析工具：RNAenrich
- 非编码 RNA 富集分析工具： RNAenrich 在过去的 25 年里，非编码 RNA(ncRNAs) 引领了生物医学和生命科学研究的流行趋势，对 ncRNAs 及其相关领域的兴趣不断扩大。随着对 ncRNA 研究的不断深入，几种调节性 ncRNA ，包括 microRNA (miRNA) 、长链非编码 RNA (lncRNA) 、环状 RNA ( ...
- 首个全面的耐药性信息景观：DRESIS
- 首个全面的耐药性信息景观： DRESIS 广泛的耐药性已成为地方 / 全球卫生保健的一个关键问题，因此，地方政府和世界卫生组织为了解决这一关键问题，已经投入了大量的努力来发现新的化合物 ( 如变构调节剂 ) ，提出有效的药物组合和开发新的生物技术 ( 如 PROTAC) ，有效地克服相应的耐药性。众 ...
- 生物信息资源平台：bio.tools
- 生物信息资源平台： bio.tools 生命科学在很大程度上依赖于高通量技术来理解，例如，基因结构、表达、调节和变异对人类健康、福祉和环境的功能影响。其结果是前所未有的大量复杂的、高度异质的生物信息，这些信息可能跨越多个科学学科，如遗传学、生态学和农业。为此，开发了许多软件工具和数据库来管理 ...
- 基因组、药物基因组和免疫基因组水平基因集癌症分析平台：GSCA
- 基因组、药物基因组和免疫基因组水平基因集癌症分析平台： GSCA 癌症是一种多种基因或通路发生改变的复杂疾病。因此，开发基于多组学数据的平台对癌症研究中的关键基因和通路进行基因集分析 (GSA) 是至关重要的，因为基因集是一组在特定生物学通路或条件下具有相似功能或共调控或共表达的基因。 GSA ...
- 单细胞分辨率下细胞通讯比较分析
- 单细胞分辨率下细胞通讯比较分析 复杂的多细胞生物依赖于其组织生态位内部和之间的协调来维持体内平衡，并对内部和外部的扰动做出适当的反应。这种协调是通过细胞 - 细胞通讯 ( cell–cell communication ， CCC) 实现的，细胞通过这种通讯发送和接收影响细胞表型和功能的生化和物理信号。系统生物 ...
- 细胞通讯方法Scriabin评述
- 细胞通讯方法 Scriabin 评述 细胞通讯对多细胞生物的正常发育和体内平衡至关重要。由配体 - 受体对介导的通讯途径可以从单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 数据中推断出来，但现有的方法在细胞类型或集群水平上进行分析，从而失去了有价值的细胞特异性信息。现在，《 Nature Biotechnology 》上的 ...
- 进化博弈论对理解和治疗癌症的贡献
- 进化博弈论对理解和治疗癌症的贡献 癌症是一种不受调节的增殖疾病，是由负责调节细胞分裂的基因功能异常引起的。癌症的发生与人类生命史有着密切的联系，其发展是由自然选择驱动的，癌细胞特征表现出以下三种条件 : 1. 可遗传变异的存在 : 可遗传性状在不同癌细胞之间存在差异，最终是基因突 ...
- ICU数据分析的R接口：ricu
- ICU 数据分析的 R 接口： ricu 近年来，电子健康记录的收集有了显著的增长，为大量数据驱动研究提供了机会和基础，这些研究旨在帮助临床医生做出决策，从而改善患者护理和健康结果。虽然越来越多收集到的患者数据可能不容易被重症医师用于决策，但这为机器学习 (ML) 方法的应用提供了机会。 ...
- 单细胞分辨率下的胶质母细胞瘤异质性
- 单细胞分辨率下的胶质母细胞瘤异质性 胶质母细胞瘤 (GBM) 是最常见和最致命的恶性脑肿瘤， 5 年生存率仅为 7% 。虽然所有恶性脑肿瘤的总生存率在过去十年中显著增加，但 GBM 的生存率一直很低。目前治疗 GBM 的护理标准是手术加放疗和化疗。由于 GBM 患者在接受标准治疗后的前景仍然严峻，人们 ...
