zhangjunpeng的个人博客

微信公众号是否有必要应用于课程教学过程中？以下是一份关于课程微信公众号的问卷调查，你们的回答就是答案。 截止目前，总共收到794份调查问卷。总体而言，大家还是比较认同微信公众号应用于课程教学过程中（91.69%的调查对象想微信公众号发布课程相关文章）。另外，大部分调查对象（61.34%）都想通过微信公众号增长 ...

写在前面 存储、可视化和分析生物数据的交互式生物 Web 应用程序是生物信息学领域的一个重要课题。在生物数据分析和生物信息学领域， R 是最受欢迎的编程语言之一。然而，在 Shiny 工具包被 RStudio 公司于 2012 年开发之前， R 用户搭建交互式 Web 应用程序面临不小的挑战。 Shiny 通过将 R 代码编译成 HTML 、 CSS ...

写在前面 单细胞测序让我们能够在前所未有的精度水平下研究基因表达，该技术同时衍生了众多单细胞数据分析方法。目前单细胞数据分析方法繁多，如何从这些方法中挑选适用于用户自己的单细胞数据分析方法，成为了大家的关注点。基于此，本次推荐一份单细胞数据分析教程《 Current best practices in single-cell RNA-se ...

给你 5 分钟（ 20 张幻灯片，每张停留 15 秒），你能够以科普形式讲清楚你从事的研究与工作吗？时间限制是一个挑战，该挑战要求演讲者必须用精炼和通俗的演讲方式来传递自己的思想。如果你想往这方面靠拢，本次就推荐一个 5 分钟短视频平台： Ignite （ http://www.ignitetalks.io/ ，图 1 ）。该平台致 ...

写在前面 随着适用于大范围数据训练和大规模下游任务分析的通用模型（例如 BERT 、 DALL-E 和 GPT-3 ）发展，人工智能（ Artificial Intelligence ，简称 AI ）正在经历范式变革。 AI 内的通用模型也叫基础模型，那么基础模型未来面临的机遇与风险如何？本次就推荐一篇发表在 arXiv 预印本的综述报告《 On the opport ...

微信公众号是否有必要应用于课程教学过程中？以下是一份关于课程微信公众号的问卷调查，你们的回答就是答案。

写在前面 在 PLoS Computational Biology 杂志中，曾经发表了一篇标题为《 Ten simple rules for biologists initiating a collaboration with computer scientists 》（图 1 ）的文章。当生物学家想与计算机学家合作时，里面的第一条规则是：不要试图将计算机学家变成生物学家（ Do not try to turn them into biolo ...

写在前面 基于单细胞转录组数据，我们有机会在单细胞精度水平下研究基因调控（ 单细胞水平 miRNA 调控 ）。在上次，已经推荐了 CSN （ C ell- S pecific N etwork ）方法来识别单细胞特异性基因网络。本次再介绍一个 CSN 改进方法： c-CSN （ C onditional C ell- S pecific N etwork ）。 ...

因果推理可以让机器学习具备可解释性，将因果推理与机器学习结合，将是迈向人工智能 2.0 的关键步骤。既然这么重要，本次推荐 1 篇国产杂志《 Engineering 》邀约的综述性论文《 Causal Inference 》（图 1 ）。 图 1 综述性论文《 Causal Inference 》 该综述性论文由国内外在因果推理领 ...

写在前面 因果推理模型除了识别 miRNA 靶基因（ miRNA 靶基因识别之 IDA ， miRNA 靶基因识别之 DirectTarget ， miRNA 靶基因识别之 JointIDA 和 miRNA 靶基因识别之 hiddenICP ），而且还能够识别 miRNA 活性。这次说一下基于因果推理方法识别 miRNA 活性。 01 — 动机 ...