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基因组、药物基因组和免疫基因组水平基因集癌症分析平台:GSCA
张俊鹏 2023-7-10 12:15
基因组、药物基因组和免疫基因组水平基因集癌症分析平台: GSCA 癌症是一种多种基因或通路发生改变的复杂疾病。因此,开发基于多组学数据的平台对癌症研究中的关键基因和通路进行基因集分析 (GSA) 是至关重要的,因为基因集是一组在特定生物学通路或条件下具有相似功能或共调控或共表达的基因。 GSA ...
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单细胞分辨率下细胞通讯比较分析
张俊鹏 2023-7-7 07:22
单细胞分辨率下细胞通讯比较分析 复杂的多细胞生物依赖于其组织生态位内部和之间的协调来维持体内平衡,并对内部和外部的扰动做出适当的反应。这种协调是通过细胞 - 细胞通讯 ( cell–cell communication , CCC) 实现的,细胞通过这种通讯发送和接收影响细胞表型和功能的生化和物理信号。系统生物 ...
个人分类: 科普|1189 次阅读|没有评论
细胞通讯方法Scriabin评述
张俊鹏 2023-7-5 09:43
细胞通讯方法 Scriabin 评述 细胞通讯对多细胞生物的正常发育和体内平衡至关重要。由配体 - 受体对介导的通讯途径可以从单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 数据中推断出来,但现有的方法在细胞类型或集群水平上进行分析,从而失去了有价值的细胞特异性信息。现在,《 Nature Biotechnology 》上的 ...
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进化博弈论对理解和治疗癌症的贡献
张俊鹏 2023-7-3 09:52
进化博弈论对理解和治疗癌症的贡献 癌症是一种不受调节的增殖疾病,是由负责调节细胞分裂的基因功能异常引起的。癌症的发生与人类生命史有着密切的联系,其发展是由自然选择驱动的,癌细胞特征表现出以下三种条件 : 1. 可遗传变异的存在 : 可遗传性状在不同癌细胞之间存在差异,最终是基因突 ...
个人分类: 科普|840 次阅读|没有评论
ICU数据分析的R接口:ricu
张俊鹏 2023-6-30 13:04
ICU 数据分析的 R 接口: ricu 近年来,电子健康记录的收集有了显著的增长,为大量数据驱动研究提供了机会和基础,这些研究旨在帮助临床医生做出决策,从而改善患者护理和健康结果。虽然越来越多收集到的患者数据可能不容易被重症医师用于决策,但这为机器学习 (ML) 方法的应用提供了机会。 ...
个人分类: 科普|1161 次阅读|没有评论
单细胞分辨率下的胶质母细胞瘤异质性
张俊鹏 2023-6-28 10:35
单细胞分辨率下的胶质母细胞瘤异质性 胶质母细胞瘤 (GBM) 是最常见和最致命的恶性脑肿瘤, 5 年生存率仅为 7% 。虽然所有恶性脑肿瘤的总生存率在过去十年中显著增加,但 GBM 的生存率一直很低。目前治疗 GBM 的护理标准是手术加放疗和化疗。由于 GBM 患者在接受标准治疗后的前景仍然严峻,人们 ...
个人分类: 科普|1027 次阅读|没有评论
超越集体智慧:集体适应
张俊鹏 2023-6-26 10:56
超越集体智慧:集体适应 人类生活普遍由各种规模和持久性的集体所构成,从小型团体 / 团队到大型组织 / 社区。集体塑造并被个体认知、互动模式以及他们遇到和创造的问题结构所塑造。我们集体的规模和复杂性迅速增长,潜在地放大了对我们社会的威胁,这些威胁难以理解和预测,包括阴谋论传播、否认事实、 ...
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肿瘤微环境的演变:从癌变起始到转移生长
张俊鹏 2023-6-23 11:33
肿瘤微环境的演变:从癌变起始到转移生长 在过去的几十年里,我们对癌症的理解发生了根本性的变化。我们现在认识到,癌症不仅仅是一种遗传性疾病,而是一个复杂的生态系统,涉及范围广泛的非癌细胞及其在肿瘤内无数的相互作用。我们认识到,基因改变对于癌症的发生和发展是必要的,但不是充分的。在实体瘤的 ...
个人分类: 科普|1113 次阅读|没有评论
因果推理第一课
张俊鹏 2023-6-23 11:31
因果推理第一课 维基百科:因果推断是在一个较大系统内部确定指定现象的实际、独立效果的过程。因果推断和相关性推断的主要区别是前者分析结果变量在其原因变量变化时发生的回应。研究事物起因的科学则称作原因论。因果推断可给出因果关系推理建立的因果关系模型的证据。目前,因果推断在所有科学中都得到了 ...
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集体行为动力学的多尺度回顾:从快速反应到个体发生和进化
张俊鹏 2023-6-19 09:42
集体行为动力学的多尺度回顾:从快速反应到个体发生和进化 人们对群体生活的收益和成本进行了广泛的研究,这些收益和成本的变化有助于解释为什么动物王国的社会行为存在如此大的多样性。避免被捕食的风险是群体生活的普遍解释,而争夺食物和疾病传播是共同的成本。虽然群体生活的行为生态学有着悠久的研究历 ...
个人分类: 科普|1147 次阅读|没有评论

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