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克服同步性和间接效应困扰的一种通用因果推理方法
张俊鹏 2023-9-15 07:04
克服同步性和间接效应困扰的一种通用因果推理方法 确定因果相互作用对于理解自然界系统的潜在机制至关重要。最近使用先进技术的时间序列数据收集的激增为计算揭示因果关系提供了机会。各种无模型方法，如格兰杰因果关系 (GC) 和收敛交叉映射 (CCM) ，已被广泛用于从时间序列数据中推断因果关系。虽然它 ...
个人分类: 科普|861 次阅读|没有评论
脑网络通讯：概念、模型和应用
张俊鹏 2023-9-11 06:57
脑网络通讯：概念、模型和应用 神经系统是通讯网络。神经元素之间的信号和信息传递遍布到脑功能的各个方面和空间尺度 — 从神经元到神经元的突触传递，到神经元群之间的相互作用，再到区域共激活的全脑模式。理解控制神经信号灵活调节的机制是现代神经科学的持久挑战之一。解决这一问题的努力涉及多个研究 ...
个人分类: 科普|917 次阅读|没有评论
人工智能时代的科学发现
张俊鹏 2023-9-8 10:07
人工智能时代的科学发现 形成科学见解和理论的基础是如何收集、转换和理解数据。 2010 年代初，深度学习的兴起极大地扩展了这些科学发现过程的范围和雄心。人工智能 (AI) 越来越多地应用于科学学科，用于整合大量数据集，改进测量，指导实验，探索与数据兼容的理论空间，并提供与科学工作流程集成的可操 ...
个人分类: 科普|963 次阅读|没有评论
癌症自己创造运气：癌症起源理论
张俊鹏 2023-9-6 06:40
癌症自己创造运气：癌症起源理论 任何疾病的成功治疗都需要了解病变组织中起作用的生物学。在 19 世纪和 20 世纪早期，传染病是导致死亡的主要原因 ( 图 1) 。早期认识到这些疾病可以通过适当的检疫和卫生措施加以预防，随后发现细菌和病毒是它们的病原体，这启发了基础研究，预防和靶向化疗计划。 ...
个人分类: 科普|907 次阅读|没有评论
spongEffects：ceRNA模块识别
张俊鹏 2023-9-4 11:10
spongEffects ： ceRNA 模块识别 尽管最近在筛查、诊断和预后方面取得了进展，并且对肿瘤发生、进展和维持的机制也有了更多的了解，但到 2040 年，仅在美国，癌症死亡人数估计将达到每年 40 万人，这突显了对诊断、监测和治疗的创新方法需求。除了基因组变异和基因表达的传统研究外，鉴于 mic ...
个人分类: 科普|754 次阅读|没有评论
包含细胞上下文信息的细胞互作数据库：CCIDB
张俊鹏 2023-9-1 08:51
包含细胞上下文信息的细胞互作数据库： CCIDB 生物系统由许多细胞组成，这些细胞之间的相互作用导致重要生物信号的交换，这些信号在维持生物功能方面发挥着重要作用。到目前为止，已经鉴定出各种类型的细胞 - 细胞相互作用（ CCI ），包括配体 - 受体相互作用、细胞外基质（ ECM ） - 受体和受 ...
个人分类: 科普|873 次阅读|没有评论
小世界网络理论25周年
张俊鹏 2023-8-30 17:28
小世界网络理论 25 周年 网络就像是研究许多物理系统的一个明显的数学框架，比如电网、大脑（图 1 ）和社交媒体平台。如今，有大量关于如何组织此类网络的理论工作，但事实并非总是如此。尽管对网络的研究有着悠久的历史，但在很长一段时间里，它最接近于将真实世界的网络描述为随机图，但大多数系 ...
个人分类: 科普|850 次阅读|没有评论
生物信息学教育和培训面临的重大挑战
张俊鹏 2023-8-28 07:02
生物信息学教育和培训面临的重大挑战 生命科学和健康科学界正面临着一个关键的挑战，即管理一个越来越定量和数据驱动的发现过程。应对这一挑战的关键是生物信息学，它可以被定义为从大量生物数据和信息中收集、管理、分析、建模和生成预测的科学。生物信息学是一个高度跨学科的领域，涉及许多专业的专业知识 ...
个人分类: 科普|867 次阅读|没有评论
抗衰老策略的当前趋势
张俊鹏 2023-8-25 07:59
抗衰老策略的当前趋势 衰老是人体发生系统性变化的自然过程，它导致功能下降，患年龄相关疾病的风险增加，最终导致死亡。尽管进行了几十年的观察和研究，但这一过程尚未被人类干预有效改变。然而抗衰老疗法和化妆品的市场价值近 600 亿美元，预计在未来 5 年内将增长 50% 。尽管人们对此非常感兴趣，但该领域 ...
个人分类: 科普|841 次阅读|没有评论
miRNA靶向蛋白质编码区的规则
张俊鹏 2023-8-23 07:56
miRNA 靶向蛋白质编码区的规则 微小核糖核酸（ miRNAs ）是一种小的非编码 RNA ，构成 RNA 诱导沉默复合物（ RISC ）的靶识别成分。在这一作用中，他们通过将 RISC 募集到靶 mRNA 转录物中来促进基因表达，导致靶 mRNA 的翻译抑制或不稳定。 miRNAs 发挥作用的典型机制已经很好地建立起 ...
个人分类: 科普|807 次阅读|没有评论
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