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文献订阅App只推荐一个!
张俊鹏 2021-10-2 12:52
写在前面 每天如果手动检索自己领域的最新文献,耗时耗力而且麻烦,另外还有检索不全的风险。以往许多工具也能够帮助了解领域的最新文献,例如 PubMed ( https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ )、 Stork 文献鸟( https://www.storkapp.me/ )、部分文献管理器(如 Mendeley , https://www.mendeley.com/ ...
个人分类: 科普|2501 次阅读|没有评论
miRNA有个DIANA系列!
张俊鹏 2021-9-30 09:22
写在前面 DIANA 的中文译为黛安娜,源于希腊神话中的月亮女神狄安娜。由于寓意很好,许多人以 DIANA 为名,例如,英国威尔士黛安娜王妃,美国 RB 歌手戴安娜罗斯。甚至在 miRNA 方面,也有个 DIANA 系列。 01 — DIANA 系列 DIANA 系列针对 miRNA 开发了一系列分析工具(图 1 ),包 ...
个人分类: 科普|1472 次阅读|没有评论
miRNA序列与表达谱数据库
张俊鹏 2021-9-28 09:29
写在前面 基因序列和基因表达谱是研究 miRNA 的两大数据类型。对于 miRNA 序列数据库而言, miRBase 一家独大;对于 miRNA 表达谱数据,主要有 GEO 、 ArrayExpress 、 TCGA 和 NGDC 四个数据库。 01 — miRBase 如果要从基因序列层次水平研究 miRNA ,就得下载 miRNA 序列数据。要想获得 mi ...
个人分类: 科普|2320 次阅读|没有评论
专利数据库推荐一波!
张俊鹏 2021-9-25 08:05
写在前面 在高校,教师和科研人员主要关心项目、论文和人才计划等。对高校专利而言,其布局和重视程度还有待提高。对于普通专利申请者,在申请一项专利前必须要检索相关的国内外专利数据库,以确保专利的新颖性。那么,对于普通人员,国内外有哪些免费的专利数据库呢? 01 — 何谓专利? 查 ...
个人分类: 科普|1849 次阅读|没有评论
Tools4miRs:只为miRNA分析
张俊鹏 2021-9-23 09:35
写在前面 全面收集已有数据库是一个辛苦活,因为需要不停的关注数据库开发动态。这里, miRNA 数据库也不例外。今天就推荐一个专门收集 miRNA 数据库的网站 Tools4miRs ( https://tools4mirs.org/ )。可以为大家省下不少 miRNA 研究时间。 01 — Tools4miRs 2016 年,在 Bi ...
个人分类: 科普|1243 次阅读|没有评论
miRNA也走非主流路线!
张俊鹏 2021-9-21 12:13
写在前面 miRNA 主流路线:通过碱基互补配对原则, miRNA 靶向 mRNA 来完成剪切、抑制翻译和蛋白质降解过程。如果 miRNA 只有主流路线,那么其流行程度会大大降低。那么,除了主流路线, miRNA 的非主流路线有哪些呢? 非主流路线 2018 年,在 Cell 杂志中发表了一篇标题为《 SnapShot: Unconventi ...
个人分类: 科普|1566 次阅读|没有评论
韦恩图在线软件推荐一波!
张俊鹏 2021-9-18 09:21
写在前面 韦恩图( Venn diagram )也叫文氏图、温氏图和维恩图。它能够表示多个集合之间的特异性和共同性。很多软件都可以绘制韦恩图,例如 R 和 Python ,一行代码就可以出结果。如果不愿尝试写代码,在线软件也可以出韦恩图。这次就推荐几款不错的韦恩图在线软件。 推荐 第一款推荐是 EVe ...
个人分类: 科普|6725 次阅读|没有评论
What?植物miRNA能够调控动物靶基因?
张俊鹏 2021-9-16 09:09
写在前面 2017 年在深圳参加 APBC ( The Fifteenth Asia Pacific Bioinformatics Conference )会议时,第一次听到了关于植物 miRNA 调控动物靶基因的学术报告(题目为“ Plant miRNAs found in human circulating system provide evidences of cross kingdom RNAi ”,如图 1 )。当时觉得非常不可思议!在会议现 ...
个人分类: 科普|1337 次阅读|没有评论
miRNA是何方神圣?
张俊鹏 2021-9-14 09:19
写在前面 从 1993 年发现第一个 miRNA ( lin -4 ),至今将近 28 年。再过 2 年, miRNA 就要而立之年了。这么多年来, miRNA 成就了很多硕士和博士。在 CNKI 知网里面搜索一下关键词“ miRNA ”,发现有 5054 篇博士学位论文和 7669 篇硕士学位论文。以下是这些学位论文的年度趋势图(图 1 )、前 10 强高校( ...
个人分类: 科普|1609 次阅读|没有评论
生信微信公众号推荐一波!
张俊鹏 2021-9-11 08:16
写在前面 查阅微信公众号信息已经成为现代人的一种习惯。有些人通过微信公众号看新闻和视频,有些人是了解最新前沿动态,甚至还有一些人是学习新技能。当然,对于日新月异的生物信息学,查阅微信公众号信息也是很有必要的。当然,阅读学术论文、经典书籍和实践操作是关键,查阅微信公众号是辅助。这次就推荐一下生物 ...
个人分类: 科普|2487 次阅读|没有评论

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