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韦恩图在线软件推荐一波!

已有 6777 次阅读 2021-9-18 09:21 |个人分类:科普|系统分类:科普集锦

写在前面

韦恩图(Venn diagram)也叫文氏图、温氏图和维恩图。它能够表示多个集合之间的特异性和共同性。很多软件都可以绘制韦恩图,例如RPython,一行代码就可以出结果。如果不愿尝试写代码,在线软件也可以出韦恩图。这次就推荐几款不错的韦恩图在线软件。

 

推荐

第一款推荐是EVennhttp://www.ehbio.com/test/venn/,如图1)。除了能够画韦恩图(最多6个集合),还能够画欧拉图、UpSet图、花瓣图、韦恩网络图。

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1 EVenn在线软件

 

第二款是Venn diagramshttp://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/,如图2. 该在线软件没有发文章,但能够画超过6个集合的韦恩图(毕竟一般在线软件最多能画6个集合)。

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2 Venn diagrams在线软件

 

第三款是jvennhttp://jvenn.toulouse.inra.fr/app/example.html,如图3)。jvenn最多能画6个集合的韦恩图,每个集合的配色比较好。

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3 jvenn在线软件

 

第四款是Vennyhttps://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/,如图4)。Venny最多能画4个集合的韦恩图,还可以显示百分比数据。

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4 Venny在线软件

 

最后一款是BioVennhttp://www.biovenn.nl/index.php,如图5)。BioVenn最多能画3个集合的韦恩图,可以自定义标题和子标题。

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5 BioVenn在线软件

 

后话

如果使用了以上韦恩在线软件,建议引用相关参考文献或链接哦。在线软件不够的话,还有一款离线软件TBtoolshttps://github.com/CJ-Chen/TBtools/releases)也可以画韦恩图。当然,TBtools还可以离线做很多其他分析(例如序列比对、富集分析、热图、UpSet图、火山图等)。感兴趣的可以下载下来玩玩。

 

以往推荐:

1. 代码收留站推荐一波!

2. 文献管理器推荐一波!

3. 生信书籍推荐一波!

4. 生信微信公众号推荐一波!

 

参考文献:

[1] Chen T, Zhang H, Liu Y, Liu YX, Huang L. EVenn: Easy to create repeatable and editable Venn diagrams and Venn networks online J Genet Genomics. 2021;S1673-8527(21)00217-4. doi: 10.1016/j.jgg.2021.07.007.

[2] Bardou P, Mariette J, Escudié F, Djemiel C, Klopp C. jvenn: an interactive Venn diagram viewer. BMC Bioinformatics. 2014;15(1):293.

[3] Oliveros, J.C. (2007-2015) Venny. An interactive tool for comparing lists with Venn's diagrams. https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html.

[4] Hulsen T, de Vlieg J, Alkema W. BioVenn - a web application for the comparison and visualization of biological lists using area-proportional Venn diagrams. BMC Genomics. 2008;9:488.

[5] Chen C, Chen H, Zhang Y, et al. TBtools: An Integrative Toolkit Developed for Interactive Analyses of Big Biological Data. Mol Plant. 2020;13(8):1194-1202.

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