写在前面

宏观层面，人、动物和植物等物种之间都有共同语言以便交流。如果没有共同语言，等同于鸡同鸭讲和对牛弹琴。微观层面，细胞间也存在共同语言进行通讯（cell-cell communication），甚至分子之间也存在共同语言，比如ceRNA或miRNA海绵竞争。本次就说说分子层面中miRNA海绵竞争所使用的语言，以及拓展的ncRNA海绵竞争所使用的语言。

MRE语言

ceRNA也称为miRNA海绵，它们交流的共同语言是miRNA结合位点（miRNA binding sites），即MREs（MiRNA Response Elements）。通过竞争性结合miRNA，miRNA海绵之间展开了“争夺”miRNA的拔河比赛（图1）。在拔河比赛中（海绵1-miRNA-海绵2），miRNA因为“共同语言”（MREs）充当媒介，将两个对象（海绵1和海绵2）联系了起来。

图1 RNA海绵之间竞争性“争夺”miRNA

NRE语言

ncRNA种类繁多，包括miRNA，lncRNA，circRNA，pseudogen以及piRNA等。其中，miRNA是研究最为普遍的ncRNA。除了miRNA，其他许多ncRNA也具有调控功能，并且与靶基因也存在结合位点。基于此，不难想象：是否存在更加广义的ncRNA海绵，将不同RNA分子联系起来？与miRNA海绵类似，ncRNA海绵的共同语言是ncRNA结合位点（ncRNA binding sites），也就是NREs（NcRNA Response Elements）。通过竞争性结合ncRNA，ncRNA海绵之间也展开了“争夺”ncRNA的拔河比赛（图2）。在拔河比赛中（海绵1-ncRNA-海绵2），ncRNA因为“共同语言”（NREs）充当媒介，将两个对象（海绵1和海绵2）联系了起来。

图2 RNA海绵之间竞争性“争夺”ncRNA

因为“共同语言”，RNA之间的竞争场地从单纯竞争miRNA拓展到竞争ncRNA。未来，竞争场地还在进一步扩大中！

参考文献：

[1] Salmena, L., Poliseno, L., Tay, Y., Kats, L.,& Pandolfi, P. P. (2011). A ceRNA hypothesis: The Rosetta Stone of a hidden RNA language? Cell, 146(3), 353–358. https://doi.org/10.1016/j.cell.2011.07.014.

[2] Tay, Y., Rinn, J., & Pandolfi, P. P. (2014). The multilayered complexity of ceRNA crosstalk and competition. Nature, 505(7483), 344–352. https://doi.org/10.1038/nature12986.

更多背景知识如下：

1.ceRNA！你是谁？为了谁？

2.ceRNA漫画，看吗？

3. 什么？ceRNA竞争除了“单挑”模式，还可能有“组队”模式？

4. ceRNA，是与非！

为了便于交流，我们为ceRNA研究在Frontiers in Molecular Biosciences杂志（ 2020_IF = 5.246）整了个专刊，主题为“Computational Identification of ceRNA Regulation”。投稿链接：https://www.frontiersin.org/research-topics/24340/。