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jdx光谱数据格式整理脚本
李继存 2014-8-3 07:59
NIST Chemistry WebBook 可以查到许多物质的红外光谱, 这些光谱数据以jdx格式给出. 下面的脚本可用于将jdx格式的光谱数据转成普通的格式, 以便用于作图. # Language: bash awk '' BEGIN { Ytrs = 0 } / YUNITS = TRANSMITTANCE / { Ytrs = 1 } / XFACTOR / { sub ( / . + = / , ...
个人分类: 我的工具箱|5102 次阅读|没有评论
全排列输出算法
李继存 2014-8-3 07:55
下面的代码用于生成几个数据的全排列, 在有些时候需要用到, 当然元素个数不要太多. # Language: bash awk ' BEGIN { Ndat = 5 ; for ( i = 1 ; i = Ndat ; i ++ ) p = i ; for ( i = 1 ; i = Ndat ; i ++ ) printf ( %3d , p ) print ; ...
个人分类: 我的工具箱|2289 次阅读|没有评论
VASP使用
李继存 2014-7-19 04:53
VASP的使用方法设计的缺陷很大, 如果只是简单算个东西, 倒也可以, 若是想大规模使用, 成千上百的文件, 都有着一样的名字, 看了不疯才怪. 所以, 我们需要一个脚本, 将VASP计算的流程进行改造. 改造的原则是支持不同文件名, 且不同文件之间可任意组合. 创建赝势文件POTCAR的脚本 整理好四种赝势文件, uspp.LDA, uspp.GGA ...
个人分类: 我的工具箱|7420 次阅读|没有评论
GNU Parallel
李继存 2014-7-19 04:51
简单的并行, 可使用GNU parallel. GNU parallel是一个perl脚本, 只要设置好路径, 即可使用. 安装 到 GNU官网 下载最新版本 解压, 得文件夹parallel-20140522 参考README编译安装 非root用户, 参照Personal installation 直接使用, 参照Minimal installation, 将脚本复制到目标路径即可. 使用 官方文档, parall ...
个人分类: 我的工具箱|4236 次阅读|没有评论
NICS计算及其图示
李继存 2014-7-19 04:50
使用PQS计算NICS(Nuclear Independent Chemical Shift), 示例输入文件(环丁二烯)如下 TEXT=Cyclobutadiene NICS dense grid for visualizationGEOM=PQS SYMM=0.0c -0.793380 -0.661025 0.002932h 1.560349 1.4230 ...
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Jmol的扩展xyz文件格式
李继存 2014-7-19 04:48
与原始格式相比, Jmol所支持的xyz格式有所扩展 Jmol xyz格式 1 2 3 4 5 6 7 8 Natm Tips Sym x y z Sym x y z vibX vibY vibZ Sym x y z FormalCharge(integer)/PartialCharge(decimal) Sym x y z FormalCharge(integer)/PartialCharge(decima ...
个人分类: 我的工具箱|6657 次阅读|没有评论
markdown幻灯片
李继存 2014-7-19 04:47
利用Markdown和DZslice制作的幻灯片, 适合用于网上课件展示. ◆图片/表格/公式/代码完整版请参 看: markdown幻灯片 ◆
个人分类: 我的工具箱|2771 次阅读|没有评论
UTF-8符号
李继存 2014-7-19 04:46
UTF-8符号 # 00 01 02 03 04 05 06 07 08 09 0 �         1       2           3   ! # $ % ' 4 ( ) * + , - . / 0 1 5 2 3 4 5 6 7 8 9 : ; 6 = ...
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合流超几何函数解H原子Schrödinger方程
李继存 2014-7-19 04:38
Schrödinger方程$:$ Ψ ( r , θ , φ ) = E Ψ ( r , θ , φ ) 其中 ∇ 2 = 1 r 2 ≡ 1 r 2 ( ∇ r 2 ...
个人分类: 数学轮子|10089 次阅读|没有评论
转战GitHub
热度 2 李继存 2014-7-8 07:20
2014-06-06 18:09:49 在科学网写了一段时间的博客之后, 对发文的要求和格式都已经很熟悉了, 但是时间长了仍觉得很受限制, 恰如阮一峰在一篇博文中 总结 的那样: 喜欢写Blog的人, 会经历三个阶段. 第一阶段, 刚接触Blog, 觉得很新鲜, 试着选择一个免费空间来写. 第二阶段, 发现免费空间限制太多, 就自己购买域名和空间 ...
个人分类: 成神颇难|2661 次阅读|4 个评论 热度 2

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