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八面体与截角八面体团簇的构建及代码实现
热度 2 李继存 2014-12-16 07:51
2013-08-16 13:53:46 初稿2014-12-15 17:17:19 修正代码bug, 增加网络版工具 八面体和截角八面体构型在纳米金属团簇的结构中比较常见, 在展示或计算时我们都需要构建这些结构$.$ 原理：正方体切除6顶点得正八面体, 正八面体切除6顶点得截角八面体 具体方法：长度以原子个数计, 以简单立方晶胞为例, 面心立方、体心立方晶 ...
个人分类: 我的工具箱|8635 次阅读|4 个评论 热度 2
物理化学中的标准态符号
热度 1 李继存 2014-12-12 12:32
2014-12-11 22:21:13 物理化学中表示标准态的符号并不统一, 在维基百科 标准状态 条目中对此有介绍, 也讲到常用的几种表示方法$.$ 直接用小写字母o或数字 0 表示, 像这样: p 0 , p o 网页中可以使用 psupso/s 表示, 像这样: p o 用u ...
个人分类: 我的工具箱|15531 次阅读|2 个评论 热度 1
从光谱到颜色
热度 1 李继存 2014-12-9 01:09
2014-12-08 11:02:23 颜色是一种很奇妙的东西, 通常看到的颜色受多种条件影响, 计算机显示的颜色也是一样. 相关的学科是色度学, 其中的关键是确定颜色匹配函数和定义颜色空间, 有了这两种东西就可以定量地描述颜色了. 国际照明委员会简称CIE(为其法文缩写)制定了颜色匹配函数(或称标准色度观察者), 开始时直接使用了基于红 ...
个人分类: 数学轮子|8361 次阅读|4 个评论 热度 1
Linux服务器映射为本地硬盘
李继存 2014-12-8 06:25
2014-12-07 16:18:14 最近看到王喜军的一篇博文 mobaXterm + SFTP Net Drive: windows下与Linux的无缝对接 , 谈到两个可以将远程的Linux服务器映射为Windows本地硬盘的软件, Swish和SFTP-NetDrive. 这种作法我以前也是知道的, 却一直没有去尝试过, 只使用着Filezilla, 觉得也还算方便. 现在既然有人又提起来, 我也就顺便去 ...
个人分类: 我的工具箱|7666 次阅读|没有评论
数据展示：请选择好的颜色映射方案
李继存 2014-11-21 02:20
在数据可视化时, 人们常常使用颜色映射图, 就是将一定范围内的数据跟一定范围内的颜色对应起来, 不同的颜色表示数据的不同大小. 这样的图在展示的时候很直观, 很清晰, 也很吸引眼球, 所以在科技论文中常常可以看到. 很多人在做颜色映射图时, 没有特别留意选用什么样的颜色范围, 颜色和数据之间以什么方式对应. 大多数人直 ...
个人分类: 数学轮子|6015 次阅读|没有评论
Hamaker方程
热度 1 李继存 2014-11-21 02:18
若粒子之间的van der Waals吸引势与距离的6次方成反比, Hamaker方程 给出了两个宏观球形粒子之间的吸引能. 当粒子之间的吸引势取其他形式时, 可利用下式进行计算$:$ E = − π 2 q 2 λ z ∫ z + R 2 ...
个人分类: 数学轮子|3746 次阅读|2 个评论 热度 1
GROMACS中文手册翻译
李继存 2014-11-11 01:11
考虑再三, 我决定征集人手将GROMACS的手册翻译成中文. 总看到有人说翻译这些科技资料没有意义, 要直接去看英文, 英文的更准确. 这些说辞当然有它的道理, 对初学者却没有太多帮助. 一个GROMACS的初学者, 他需要的是快速入门. 等入了门, 再去看英文的手册, 英文的资料也能更有信心, 不再那么害怕了. 而能快速入门的途径之一 ...
个人分类: 我的工具箱|10347 次阅读|没有评论
Taggie：基于标签的桌面搜索工具
热度 1 李继存 2014-11-3 00:01
前面有篇博文谈及基于标签的文档管理方式, 也推荐了一些软件, 但我试用后觉得都不是很满意, 决定自己山寨一个基于标签的, 类似于Google桌面搜索的工具, 叫Taggie. 想法起源于一则 留言 62 , 这使我知道了ADS这个概念. 在网络上寻找到了很多相关的资料 系统中的隐身人——ADS数据流文件 NTFS多流文件、结构化 ...
个人分类: 我的工具箱|3508 次阅读|1 个评论 热度 1
3DPDF文件
李继存 2014-11-2 23:57
早就知道PDF文件中可以插入3D模型, 可具体的作法没有深究过, 而且即便在化学领域, PDF文件中插入3D分子构型也还没有广泛流行, 原因大约还是有些麻烦吧. 相信这种趋势有着未来, 虽然未必以目前的方式. 参考资料 Tutorial: Creating 3D PDF Documents with Jamberoo The future of scientific publishing is her ...
个人分类: 我的工具箱|2923 次阅读|没有评论
PBS提交作业
李继存 2014-11-2 23:53
PBS提交作业时, 有两种模式, 单文件队列: 每个文件分配一个作业号, 独占一个队列 多文件队列: 多个文件共占一个队列, 只分配一个作业号, 此时又可分为两类运行方式 串行: 多个文件顺序执行 并行: 多个文件同时运行 根据这两种模式, 分别设计PBS脚本.
个人分类: 我的工具箱|3679 次阅读|没有评论
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