构建基因家族进化树答疑

张亮生 2014-12-9 22:12

刚才有个同学咨询构建进化树问题。 觉得有代表性，贴出来供大家参考。 感谢您及时回复我的邮件。由于我之前在构建进化树方面曾经遇到一些困难，所以我在看到您的文章之后，想从网上把您构建进化的序列下载下来详细学习，所以遇到以下几个问题： 1) Fig.1 中所用到的构建进化树的序列 ...

个人分类: 读文章笔记|18103 次阅读|没有评论

既得利益者会改革？看清华大学“综合改革方案”

热度 2 张亮生 2014-11-3 11:14

刚才看到的“ 清华大学“综合改革方案”正式获批 ”，哎，估计又是打酱油！ 清华北大是拿钱最多的学校，他们两个学校对教育贡献几乎是负数。拿到最多的钱，最大的破坏教育公平！教育怎么改？ 促进公平就可以，把教师流动起来，能者上！ 现在又让他们领头改革，难道既得利益者会扔掉自己的鸡腿，把鸡腿跟大家 ...

个人分类: 读文章笔记|3233 次阅读|2 个评论 热度 2

又一篇 new phytologist接收

热度 1 张亮生 2014-10-16 23:43

这篇是我和马红教授作为通讯作者，如下。等proof出来，我就上传上来。 这个工作是09年我开始做的，后来由li qi同学接着做。 Li Q, Zhang N, Zhang L*, Ma H*:Differential evolution of members of the rhomboid gene family with conservativeand divergent patterns. New Phytologist

个人分类: 读文章笔记|3612 次阅读|4 个评论 热度 1

复旦的cell

热度 2 张亮生 2013-12-10 19:38

Article Crystal Structure of TET2-DNA Complex: Insight into TET-Mediated 5mC Oxidation Available online 5 December 2013 Lulu Hu, Ze Li, Jingdong Cheng, Qinhui Rao, Wei Gong, Mengjie Liu, Yujiang Geno Shi, Jiayu Zhu, Ping Wang, Yanhui Xu Graphical Abstract ...

个人分类: 读文章笔记|6187 次阅读|2 个评论 热度 2

没有减数分裂的虫子，荠菜，鸭子被测序

热度 2 张亮生 2013-7-23 21:44

刚才一会看到两个基因组测序文章，有意思，有意义。 有意思的是这篇文章： Genomic evidence for ameiotic evolution in the bdelloid rotifer Adineta vaga。 nature12326.pdf bdelloid rotifer 是一种蛭形轮虫，其没有性生殖。 传统理论认为没有性生殖或减数分裂，这个物种（真核）一般是要灭亡的（Loss of se ...

个人分类: 读文章笔记|7216 次阅读|2 个评论 热度 2

H7N9最新进展--序列变异（2）

热度 3 张亮生 2013-7-5 09:24

H7N9 最新进展 -- 序列变异 （2） 禽流感有 8 个基因，分别是 HA ， NA ， M（编码M1和M2蛋白） ， PA ， NP ， NS（编码NS1和NEP （NS2）蛋白） ， PB1 ， PB2 ，其中 HA 和 NA 是膜蛋白，而另外 6 个位于核内，称为核内基因。 我们的最新研究工作 先 ...

个人分类: 读文章笔记|7548 次阅读|4 个评论 热度 3

看病最重要的是什么？

热度 4 张亮生 2012-9-18 13:34

如题，我觉得是检测结果。后面是根据结果用药，这个过程多半是医生凭经验。有两种情况： 如果三个医生给出不同的答案，那么就是有问题的。 如果三个医生给的是一样的，那么就是可以不用医生也能完成。 对于前者，标准化用药比不同的答案要强。 对于后者，就差标准化了。 这里就有一个逻辑，几百年发展下来，难道就 ...

个人分类: 读文章笔记|4052 次阅读|8 个评论 热度 4

物种多样性研究现状与发展方向

热度 1 张亮生 2011-6-14 23:22

Introduction to special issue on biodiversity http://www.amjbot.org/content/98/3.toc 今天突然看到这个专辑，今年三月份刚出来的。稍微浏览了下内容蛮好的，从植物多样性的保护，到被子植物花的形态的演化，到系统发育与被子植物演化的关系，再到物种表型的演化与分子网络（转录因子）的关系等等，包括的 ...

个人分类: 读文章笔记|3544 次阅读|2 个评论 热度 1

本页有 2 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏