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HMM模型的初步学习

2013-1-1 11:09

这几天学习了HMM模型，得到了下面的一些粗浅认识，以及对于一个简单的HMM模型的实现（Perl语言实现的）。code写得很冗余，要是把计算过程写成函数会更好。 本文只是自己的一个简单的总结，需要了解的更详细可以参考Lawrence.R. Rabiner的经典论文"A tutorial on Hidden Markov Models and selected applications in Speec ...

个人分类: 生物信息学与计算生物学|9981 次阅读|没有评论

R中用于排序的几个函数

2012-9-14 09:16

三个函数sort(),rank(),order() sort()函数返回排序后的数组，可以从小到大或者从大到小； rank()函数返回的是原数组的各个元素在排序后的秩次； order()函数返回的是对数组排序后的各个元素在原数组的位置。根据该函数可以对数组根据其某一列或者行进行排序。 比如说要对一个矩阵x进行排序，先根据第一列 ...

个人分类: 统计学与R语言学习|31494 次阅读|没有评论

对于共轭梯度最优化方法的一些认识

热度 1 2012-5-10 17:24

共轭梯度法最初由 Hesteness 和 Stiefel 于 1952 年为求解线性方程组而提出的。后来，人们把这种方法用于求解无约束最优化问题，使之成为一种重要的最优化方法。 Fletcher-Reeves 共轭梯度法，简称 FR 法。 共轭梯度法的基本思想是把共轭性与最速下降方法相结合，利用已知点处的梯度构造一组共轭方向，并 ...

个人分类: 统计学与R语言学习|22348 次阅读|2 个评论 热度 1

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