phenome的个人博客

熊江辉
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工作情况:中国航天员科研训练中心航天医学国家重点实验室,研究员
研究领域:生命科学->遗传学与生物信息学->生物信息学
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能力组学(Capomics)有望架起中医、现代医学的桥梁 【能力组学系列-3】

(转载自:《中国药理学与毒理学杂志》. 2023年9月.第37卷.专家论坛) 原文标题《从网络药理学到能力组学(Capomics)》 作者:熊江辉 5 能力组学(Capomics)有望架起中医、现代医学的桥梁 本体论( ontology)是一个哲学概念,用于精确地描述概念化,以描述事物的本质。近年来,这个词汇被应用到计算机领 ...
2023-9-30 09:56

为什么DNA甲基化测量对于能力组学如此重要?【能力组学系列-2】

(转载自:《中国药理学与毒理学杂志》. 2023年9月.第37卷.专家论坛) 原文标题《从网络药理学到能力组学(Capomics)》 4 为什么DNA甲基化测量对于能力组学如此重要? 从前文讨论中可以看出,能力( Capability),定义为生物系统适应环境的一系列能力的集合,是实现个体和物种的可持续性的手段,也是生 ...
2023-9-30 09:50

从网络药理学到能力组学(Capomics) 【能力组学系列-1】

(转载自:《中国药理学与毒理学杂志》. 2023年9月.第37卷.专家论坛) 从网络药理学到能力组学 (Capomics) 熊江辉 摘要 本文提出能力组学 (Capomics)的概念,能力组学Capomics是Omics of Capability的缩写,即从不同尺度和维度上测量表征人体内在能力的方法。本文同时也提出了一 ...
2023-9-30 09:45

基于DNA甲基化的中医“理法方药”分析(以抑郁症客观化检测为例)

近日,DeepoMe团队自主开发的DamoPa中西融合大模型新增了中医“理法方药”分析功能,正在邀请科研合作伙伴测试。先看一个图: 上图是某受试者唾液DNA甲基化检测+模型分析的结果。结果分几个板块:左边是中医证候要素的“失衡指数”(纠偏嘛,当然要先识别哪些方面“偏/失衡”更严重啦)。中间一列是治法(思路 ...
2023-8-15 15:04

综述21项科学进展,基于精准人药匹配技术,建立[AI健康干预导航图],为什么正当其时?

一、人类健康与疾病的复杂性:抑郁症治疗,居然还需要不断“试药” 据数据显示,约5%的成年人患抑郁症。疾病的复杂性超出预期,医生通常需要与患者一起“试错”,先开对很多人都管用的药,例如莱士普。如果不见效,可能几周后再换别的药。这个试错过程需要一定时间,也可能导致患者误服加剧症状的药物。一项新研究 ...
2023-7-17 16:22

免疫衰老反转:更换T细胞和NK细胞可让人年轻多少岁?

DNA甲基化衰老时钟是目前公认的量化和预测人类生物学年龄的工具。通过采集血液或唾液,通过大样本人群的DNA甲基化测量,就可以估计年龄、预测疾病风险和预期寿命。 这是为什么呢?一项发表在《Genome Biology》的论文 从免疫系统衰老的角度给出了一些答案。 【背景】 随着人们寿命的延长,人们越来越关注如 ...
2023-4-24 22:11

DamoPa:医学预训练模型(老药新用、天然产物发现专题)

一、概述 目前,最常用于表征疾病原因、药物作用机制的知识体系,主要由人类专家手工编辑形成的信号通路构成。DeepoMe(深度甲基)开发的DamoPa (Foun da tion Mo del for Medicine based on P re-tr a ining),是希望用数据驱动的方式,在大规模数据集中计算得到与人类衰老、疾病病因 ...
2023-4-24 21:55

DamoPa模型:因果涌现,48例样本也可以发现生物标志物,中医的DNA甲基化特征优势明显

目前,最常用于表征疾病原因、药物作用机制的知识体系,主要由人类专家手工编辑形成的信号通路构成。DeepoMe深度甲基开发的DamoPa (Foun da tion Mo del for Medicine based on P re-tr a ining),是希望用数据驱动的方式,在大规模数据集中计算得到与人类衰老、疾病病因与机制、药物作用相关的模型,形成预 ...
2023-4-24 16:31

DamoPa:现代医学与中医融合预训练模型

一、概述 目前,最常用于表征疾病原因、药物作用机制的知识体系,主要由人类专家手工编辑形成的信号通路构成。DeepoMe(深度甲基)开发的DamoPa (Foun da tion Mo del for Medicine based on P re-tr a ining),是希望用数据驱动的方式,在大规模数据集中计算得到与人类衰老、疾病病因与机制、药物作用相关的 ...
2023-4-24 10:01

中西医融合的三个阶段

中西医融合的三个阶段 熊江辉 【摘要】 提出中西医融合可分成临床协同、数据协同、本体论(术语)融通三个阶段的观点。其中最有挑战的是本体论融通阶段,该阶段在大数据的基础上,规模化地进行定性归纳、不断更新术语与知识结构。与数据协同阶段以统计学为内涵不同,该阶段将以信息论为主导。建议建 ...
2022-7-5 13:22
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