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基于DNA甲基化的中医“理法方药”分析(以抑郁症客观化检测为例)

已有 869 次阅读 2023-8-15 15:04 |个人分类:中西医融合|系统分类:科研笔记

近日,DeepoMe团队自主开发的DamoPa中西融合大模型新增了中医“理法方药”分析功能,正在邀请科研合作伙伴测试。先看一个图:

理法方药.png

上图是某受试者唾液DNA甲基化检测+模型分析的结果。结果分几个板块:左边是中医证候要素的“失衡指数”(纠偏嘛,当然要先识别哪些方面“偏/失衡”更严重啦)。中间一列是治法(思路),例如“去瘀”。右上方是中药排序、右下角是方剂排序。

证候要素板块,把证候分了几个系列,每个系列取“失衡指数”最高的几个术语,能读出来什么?红色箭头和大括号:“肝气郁”。是的,这是一个典型的抑郁症受试者。中医对抑郁症的辨证分型,第一大类就是“肝气郁结型”,第二大类是“心脾两虚型”(在上图中也有信号,橙色的箭头和大括号就是)。提示,当前受试者最接近的中医证型是肝气郁结,其次也有心脾两虚。

全局来看,失衡指数最高的证候要素是“胆”(蓝色箭头)。确实有不少专家是从胆论治。

理法方药2.png

        上图是一个小规模试验的统计结果。我们看这些用DNA甲基化编码表征的中医概念在抑郁人群(case)与对照人群(control)之间是否有显著差别。左上图显示了统计学差异最显著的证候要素是“肝”,p值为0.023,风险比值比为3.6(即这项测试得分高的人患抑郁症的可能性/风险是其他人的3.6倍)。单独用“肝”的甲基化特征,预测抑郁症的AUC为0.72。
       右边则是用同样方法筛选出来的,与抑郁症最相关的中医治法,包括“解郁”、“定惊”等。
上述分析用到了DeepoMe两大技术平台: (1)Capome®检测系统。基于高通量DNA甲基化测序,兼容血液(全血-18度冻存,无需离心)、唾液(常温运输,可居家采样)。 (2)DamoPa中西融合预训练模型。欢迎有兴趣的基础、临床、健康管理应用专家一起合作进一步研发和应用。





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