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使用FigTree制作环形系统发育树
热度 2 熊荣川 2015-2-4 17:20
使用 FigTree 制作环形系统发育树 # 作者信息 熊荣川 六盘水师范学院生物信息学实验室 六盘水市生物研究所 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz 系统树的形态有多种,当末端节点较多时,我们通常选用环形系统发育树 ,已达到节省版面 ...
个人分类: 我的研究|35323 次阅读|4 个评论 热度 2
开放获取期刊地址备忘录
熊荣川 2015-1-5 16:58
# 作者信息 熊荣川 六盘水师范学院生物信息学实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz Plos One http://www.plosone.org Biodata mining http://www.biodatamining.org/ 动物学研究 http://www.zoores.ac.cn/CN/volumn/current. ...
个人分类: 我的研究|4539 次阅读|没有评论
我对欧氏距离(Euclidean distance)的理解
热度 1 熊荣川 2014-12-28 09:38
我对欧氏距离(Euclidean distance)的理解 # 作者信息 熊荣川 六盘水师范学院生物信息学实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz 欧氏距离(Euclidean distance)也称 欧几里得 距离,它是一个通常采用的距离定义,它是在m ...
个人分类: 我的研究|20513 次阅读|2 个评论 热度 1
R语言分析DNA序列单倍型及其频次
熊荣川 2014-11-11 11:07
#R语言分析DNA序列单倍型及其频次 # 作者信息 熊荣川 六盘水师范学院生物信息学实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz library(pegas) path = D:/ziliao/优先阅读/R语言 学习/R语言分析DNA序列单倍型及其频次 setwd(path) fas.F - read.d ...
个人分类: 我的研究|9401 次阅读|没有评论
R语言计算DNA序列的遗传距离
热度 1 熊荣川 2014-11-10 17:10
# 作者信息 熊荣川 六盘水师范学院生物信息学实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz library(ape) path = ……/R语言计算DNA序列的遗传距离 setwd(path) fas.F = read.FASTA(seqdumpB.fas) mat = dist.dna(fas.F,as.matrix = T) ...
个人分类: 我的研究|10279 次阅读|1 个评论 热度 1
怎样将知网(CNKI)中的参考文献导入Endnote中
热度 1 熊荣川 2014-11-6 18:19
怎样将知网( CNKI )中的参考文献导入 Endnote 中 # 作者信息 熊荣川 六盘水师范学院生物信息学实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz 进入知网,找到你要导出的文献 在目标文献的前面点选选择框 选择“导出 / 参考文献” ...
个人分类: 我的研究|14920 次阅读|1 个评论 热度 1
R语言进行图形输出
熊荣川 2014-10-30 07:13
#作者信息 熊荣川 六盘水师范学院生物信息学实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz bitmap(file=outfile , type='png16m', height=6, width=6, res=600, units='in') plot(1:10) dev.off() #可以输出多种图形,如tif,jeg等,详见?bitmap,units ...
个人分类: 我的研究|8761 次阅读|没有评论
R语言进行声谱数据处理info.sonogram(path1,path2,infile)
熊荣川 2014-10-29 11:11
R 语言进行声谱数据处理 info.sonogram(path1,path2,infile) #作者信息 熊荣川 六盘水师范学院生物信息学实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz # 预装函数 # # 以下原始代码将在发布 24 小时后删除。 # 使用方法 path1 = ...
个人分类: 我的研究|3947 次阅读|没有评论
R语言提取文件的时间信息
熊荣川 2014-10-17 07:39
# 作者信息 熊荣川 王伟韬 六盘水师范学院生物信息学实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz path = #设置路径 setwd(path) #设置工作路径 file.info(表1.xls) #查询文件 表1.xls的 ...
个人分类: 我的研究|8842 次阅读|没有评论

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