#作者信息

熊荣川

六盘水师范学院生物信息学实验室

xiongrongchuan@126.com

http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz

# 预装函数

#搜索DNA序列中的非碱基符号#

#使用方法

#现在测序技术的发达，使得我们可以得到较长的序列，但是测序仪测出来的序列通常较短，小于600bp，因此往往通过拼接的方法得到长序列。拼接都是用相关的软件来完成的，这样就会在某些位点出现模棱两可的情况——一个位点由于测序信号都很弱或都很强，且碱基不一致。这个时候软件就使得该位点已包含所有可能性的简并碱基符号来代替具体碱基。当然，这是我们需要额外手工校对的地方，但是成千的上万的碱基，往往百密一疏。于是我们写下这个函数以检查序列的碱基组成，省去“肉眼”查找的繁重。