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氨基酸的溶解度

已有 9914 次阅读 2018-4-8 17:08 |个人分类:氨基酸|系统分类:科研笔记| 氨基酸, 溶解度

溶解度相关概念:饱和,沉淀。

但也可以从疏水性角度考虑,疏水性是溶解度在两种不同溶剂(油和水)中的表现的差别,那么可以不涉及饱和。

判断溶解度升高了,可以用oil/water partitioning 的办法,比较solute在两种溶剂中的浓度差。这样完全不涉及饱和。

但该溶解度在某种溶剂中不是一成不变的,是可以调控的,调控方式有温度、掺入其他物质(能和氨基酸发生相互作用)等方式。

考虑到生理溶液,说明氨基酸跟离子相互作用,是生命活动的一大基本特征。这也是蛋白质物理所不可或缺的一大部分。如果说蛋白质是乐谱,那么离子就是重音符。必须在水溶液中,那么水就是乐谱所要被大家听到的钢琴。

这个可以从建立模拟体系的过程中体会出来。

pdb2gmx-->editconf-->genbox-->genion

Or search metal ion binding protein.

金属:(如此之多)

image.png

Metal Definitions:

A substance with high electrical conductivity, luster, and malleability, which readily loses electrons to form positive ions (cations). Metals are otherwise defined according to their position on the Periodic Table, including groupings as alkali metals, alkaline earth metals, transition metals, and rare earth metals.

由于空的d轨道的存在,过渡金属很容易形成配合物。

金属离子与蛋白相互作用的一种方式就是cation-pi interaction,是一种非成键相互作用。但有时也会紧密结合。

络合:配位共价键,包括水合金属离子,都是。

可以络合金属离子的称为螯合剂,比如EDTA

https://wenku.baidu.com/view/1319e0a13c1ec5da51e2700e.html

 

考虑其对氨基酸溶液度的影响,必然是一个重要的问题。

This article shows that the transition metal do increase the solubility of some amino acids.

In this article, Cu的吸附位置,是通过计算和实验的对比,所间接证实的。

此外,该文章研究了非芳香族氨基酸的溶解度问题。


考虑蛋白质,而不是氨基酸,有一个hofmeister序列,描述的是不同的离子溶液中蛋白质的溶解度变化。



https://wap.sciencenet.cn/blog-485752-1108046.html

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