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和产量有关的抽穗期基因
热度 2 2015-2-3 11:43
看到好几个抽穗期基因都和产量或产量相关性状有关,略做小节 Hd1和Ehd1,这两个可是水稻抽穗期调控的著名基因 Flowering Time Genes Heading date 1 and Early heading date 1 Together Control Panicle Development in Rice. Ghd8 A major QTL, Ghd8, plays pleiotropic roles in r ...
个人分类: 水稻基因|5296 次阅读|3 个评论 热度 2
用于水稻产量设计的基因
2015-2-3 11:00
呵呵,玩一把“标题党”,因为我这篇博文写的不是什么产量基因,而是一篇和这个主题相关的文章里涉及的基因。这篇文章的标题是: Genes offering the potential for designing yield-related traits in rice. 这样好像能和我的标题粘点边。我没有全文,但想要得到里面的基因列表怎么办?搜 ...
个人分类: 水稻基因|5266 次阅读|没有评论
推测QTL区间候选基因的方法
热度 1 2015-1-30 14:18
这里有篇文章报道了相关内容 Prioritization of candidate genes in QTL regions based on associations between traits and biological processes http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4274756/pdf/12870_2014_Article_330.pdf 我也是刚看到文章,没测试过,有兴趣的朋友可以试下。当然如果根据这篇文章的 ...
个人分类: QTL精细定位|10237 次阅读|1 个评论 热度 1
基因组选择在杂交种选育中的应用
2015-1-30 14:08
所谓基因组选择指的是这个词:Genomic selection。这是MAS,分子标记辅助选择的升级版。下面是篇比较新的文章。 链接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25114224 标题:Predicting hybrid performance in rice using genomic best linear unbiased prediction
个人分类: 分子育种|4356 次阅读|没有评论
Nature method 专门介绍Bioconductor的文章
2015-1-30 11:41
文章标题: Orchestrating high-throughput genomic analysis with Bioconductor 链接: http://www.nature.com/nmeth/journal/v12/n2/full/nmeth.3252.html?WT.ec_id=NMETH-201502 Bioconductor是一个用R语言写的用于生物信息学分析的相关软件的集合体。好东西啊,有兴趣的朋友可以去瞧瞧,我也安了,但还没怎么用 ...
个人分类: linux|3917 次阅读|没有评论
把GFF3文件导入MySQL数据库
2015-1-29 10:13
什么是GFF3?这个一种序列注释文件的格式,基因组注释数据常常会用这种格式来记录序列注释信息,关于这种格式的更多信息,可以在这里学习: http://www.sequenceontology.org/gff3.shtml 这里简单说下,怎样把GFF3文件导入MySQL数据库,导入了以后使用比较方便。我用 ...
个人分类: linux|7663 次阅读|没有评论
适合分子育种的分子标记体系
热度 1 2014-12-11 20:48
这个是从北京开会后想到的一点东西,一点个人观点,对与错可能还需要进一步的实践来检验。我认为适合分子育种的分子标记体系是:高通量,低成本和低标记密度的体系。当然前面两个最重要,后面那个密度也主要是从成本的角度考虑,如果不影响成本,当然是密度越高越好。 ...
个人分类: 分子育种|3531 次阅读|2 个评论 热度 1
eQTL的精细定位和图位克隆
2014-12-11 20:19
我的和彩云笔记,提供了这样一个例子,笔记的最后提供了全文(http://mnote.weibo.10086.cn/share/sharenote.html?id=c1e0f16c76b9abeb05f2713b1eb53e04).文章为: http://www.plantcell.org/content/early/2014/08/12/tpc.114.128512.abstract eQTL Mapping of Transposon Silencing Reveals a ...
个人分类: QTL精细定位|9978 次阅读|没有评论
面向实战的分子育种和面向学术的分子育种
2014-12-8 19:51
昨天参加了“玉米分子育种高端研讨会”,得到消息的第一时间,我就想参加这个会议,但报名的时间比较晚,当我报名的时候,人家回复:人员已满。幸好,有徐老师,让我得以能顺利入场,并享受免费的午餐。这次会议应该是比较圆满,时间安排很紧,没有那些繁琐的形式主义的东西,也没什么会议费,与会的 ...
个人分类: 科研杂谈|2984 次阅读|没有评论
分子育种云
2014-12-4 16:17
这段时间常玩云盘,自己有好几个云盘,什么360云盘,百度云,和彩云(中国移动的)。这些云盘都能提供2T以上的免费空间,我的360云盘有60T,和彩云有55T。这个空间把我电脑上所有的东西都放上去,还用不不了它的一个零头。云时代到来了,几乎所有的信息资料都可以放在云端,可以通过手机或者电脑等 ...
个人分类: 分子育种云|3131 次阅读|没有评论

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