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关注我的朋友们可以到今日头条联系我
2022-2-14 09:30
这个博客已经比较长的时间没有更新了,昨天居然有位朋友通过科学网看到了我的博客,然后联系了我。有需要的朋友今后可以关注我的头条号bioponser,这里我经常会更新。主要是分享一些在我看来还不错的新文献。
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安装包org.Hs.eg.db失败及解决
2020-12-21 13:03
利用这个命令安装: BiocManager::install(org.Hs.eg.db) 提示信息: URL 'http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/3.12/data/annotation/src/contrib/org.Hs.eg.db_3.12.0.tar.gz': Timeout of 60 seconds was reached Warning in download.packages(pkgs, destdir = tmpd, available = available,&nb ...
个人分类: 技术和方法|14079 次阅读|没有评论
38个水稻全基因组序列
2020-11-25 19:06
我搜集的水稻基因组序列,如果有新序列出来,请告诉我下 16个下面这篇文章提到的水稻基因组 2020 A platinum standard pan-genome resource that represents the population stru.pdf 包括这些品种: Azucena_GJ-trop1 IR64_XI-1B1 IRGC_109232-1_XI-3B2 IRGC12485_cB IRGC132424_XI-2A IRGC19961_GJ-trop2 I ...
个人分类: 资料|8474 次阅读|没有评论
PDF文件的分割及合并方法
2020-11-24 20:52
昨天有同事提的需求:把一个pdf文件中的几页提取出来,生成新的pdf文件。以前干过这种事,不过时间一长就会忘记,写到这里,如果有需求下次来查。 我用的是ubantu系统,如果您的系统是windows,下面的方法不适用。 修改一下下面这段代码就可以搞定: #把要分割的 ...
个人分类: 技术和方法|2507 次阅读|没有评论
感谢科学网
热度 2 2020-11-23 20:08
这个博客,我有5年未更新了。因为5年前密码突然被盗,再加上yahoo邮箱不能用(注册的时候用的是yahoo邮箱,这个邮箱后来被阿里云收购了就没再用了)。所以,当我的密码被盗时,不能第1时间找回密码,后面一忙,这事也就一拖再拖。近日,我找点资料,居然找到自己曾今写的博文, ...
个人分类: 科研杂谈|2576 次阅读|4 个评论 热度 2
embl中的植物变异数据
2015-6-29 16:45
使用R来操作,得安装biomaRt模块,biomaRt是个什么东西,可以看下这个文件( The biomaRt user’s guide.pdf )。下面是操作过程,回头再来梳理其中相关的一些东西。 1 进入R系统: 2 把biomaRt调入: library(biomaRt) 3 利用命令listMarts(),调出所有的数据库和相关描述: listMarts() ...
个人分类: linux|6624 次阅读|没有评论
代谢产物的关联作图
热度 1 2015-3-20 16:13
Nat Genet. 2014 Jul;46(7):714-21. doi: 10.1038/ng.3007. Epub 2014 Jun 8. Genome-wide association analyses provide genetic and biochemical insights into natural variation in rice metabolism. Chen W 1 , Gao Y 1 , Xie W 1 , Gong L 1 , Lu K 1 , Wang W 2 , Li Y 2 , Liu X 3 , Zhang ...
个人分类: 关联作图|6659 次阅读|1 个评论 热度 1
9311和日本晴参考序列的比较
热度 1 2015-3-20 10:04
Plant J. 2014 Mar;77(5):795-805. doi: 10.1111/tpj.12412. Epub 2014 Feb 3. Comparative BAC-based physical mapping of Oryza sativa ssp. indica var. 93-11 and evaluation of the two rice reference sequence assemblies. Pan Y 1 , Deng Y , Lin H , Kudrna DA , Wing RA , Li L , Zhang Q , L ...
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