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关联作图中最重要的部分
2011-12-6 22:10
当然这仅仅代表个人观点,是从操作和利用的层面考虑.这里的关联作图指的是基于高密度标记和大群体的关联作图结果,例如水稻中NG上的两篇还有这篇(Genome-wide association mapping reveals a rich genetic architecture of complex traits in Oryza sativa Genome-wide association mapping reveals.pdf ...
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又1篇水稻关联作图的大作问世了
热度 1 2011-12-6 12:03
Genome-wide association study of flowering time and grain yield traits in a worldwide collection of rice germplasm ng.1018.pdf 关于水稻这方面的研究,还包括基因的定位,克隆以及基因功能研究,中国已经走在了世界的前列. 高通量测序,加上关联作图,再 ...
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稀有等位基因
2011-12-1 23:00
"rare variant",这是进行全基因组关联作图(genome-wide association,GWA),时可能会遇到的问题.所谓的稀有,其实就是其字面意思,等位基因频率较低,低到什么程度才算稀有,这个具体的研究有关(which, although we have adopted the convention 1% frequency, might range from 0.1% to 0.01%, depending ...
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连锁关联结合的方法进行QTL精细定位
热度 1 2011-9-15 21:55
An 11-bp Insertion in Zea mays fatb Reduces the Palmitic Acid Content of Fatty Acids in Maize Grain journal.pone.0024699.pdf 这是一个例子.植物中,关联-连锁结合的分析方法,应该会用得越来越多
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拟南芥的MAGIC群体
热度 2 2011-9-2 08:56
什么是MAGIC?Multiparent Advanced Generation Inter-Cross (MAGIC)lines.关于拟南芥的MAGIC见这篇文章. http://image.sciencenet.cn/olddata/kexue.com.cn/upload/blog/file/2010/9/201092721592062736.pdf MAGIC的优点:能同时结合连锁作图及关联作图的方法进行复杂性状的遗传解析. 文章摘要: Most traits ...
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徐云碧老师关于关联作图问题的答复
热度 1 2011-8-1 10:37
呵呵,这是别人问的,我得到他的允许可以把原信及回复贴在这里.关于徐老师的文章及新书介绍这篇博文里有 http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=spaceuid=479743do=blogid=391882 原邮件: 徐老师: 您好! 非常感谢您能在百忙之中抽出时间阅读我的 ...
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稀有变异的关联作图
2011-6-26 22:03
Statistical analysis strategies for association studies involving rare variants Statistical analysis strategies for association studies involving rare variants.pdf 以前发过关于这个主题的几篇争论的文章,现在翻博客居然找不到了.
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关联分析中的群体结构解决办法
2011-6-26 21:51
New approaches to population stratification in genome-wide association studies.pdf New approaches to population stratification in genome-wide association studies 又是一篇综述,刚新添文献时,看到这篇,传上来.和这个主题相关的文章还有:都集中到一起,以后可能看起来比较方便 Effi ...
个人分类: 关联作图|5134 次阅读|没有评论
基于家系的关联作图
2011-6-26 21:30
NATURE REVIEWS GENETICS:Family-based designs for genome-wide association studies family based designs for genome wide assocaition studies.pdf 基于家系的关联作图,在植物中的应用还比较少,我感觉这是个重要的方向.因为育种中有很多家系,直接利用这些家系来进行关联作图,应该是个合理的选择. ...
个人分类: 关联作图|2778 次阅读|没有评论
关于关联作图的两篇翻译文章
热度 5 2011-6-6 12:11
这是我另一个博客中学习关联作图时断断续续翻译的东西.时间已经比较长了,居然还有人搜藏,让我重新贴出来让更多的人受益.呵呵,那我就听人劝吧.为了不误导人,连原文一起附上,这样我就不用负责了.没有时间把这东西弄得更好.这两篇文章是我学习关联作图时的入门教材. 1 STRUCTURE OF LINKAGE DISEQUILIB ...
个人分类: 关联作图|3757 次阅读|3 个评论 热度 5

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