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热烈祝贺小麦基因组草图的诞生

已有 4273 次阅读 2013-3-25 14:28 |个人分类:专业随笔|系统分类:科研笔记| 小麦, 基因组

       看到这则消息,让人感到高兴http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2013/3/275978.shtm。同时,希望后续的生物信息学分析能够跟上,能够给小麦研究者提供更好的信息和工具。

      既然这个序列是我们测出来的,显然小麦基因的命名权应该掌握在中国人的手里。不要忙活了半天,只是为他人或者主要为他人作嫁衣了。

      这小麦的序列都能测出来,其它的更不在话下了。一个崭新的时代已经来临了:能迅速获得序列的时代,但这仍然是万里征的前面几步,要全面解析基因功能和阐明生命的内在逻辑,任重而道远。

      中国也比较早的给出了籼稻基因组的全序列,但我感觉在这个基础上的序列的后续分析和提供服务方面还让人不尽满意。因为我依旧常常去jcvi、gramene、NCBI等外文网站。粳稻水稻基因组的注释JCVI(以前的TIGR)已经到了Realse 7,小日本那个网站也到了 Os-Nipponbare-Reference-IRGSP-1.0 pseudomolecules这之前还有4个版本,而中国的籼稻基因组好像都没怎么更新(也许我说错了,但感觉是如此)。在发表的水稻的基因克隆论文里一般会给出基因的名字(LOC或Os开头的),这两个都是基于日本晴基因组注释数据。极少看到根据籼稻9311序列注释的基因名,为什么我们被忽略了?

     在小麦全基因组草图出来之际,真心希望这个非常好的资源首先能为中国的科学家提供更好的数据和服务,虽然科学是没有国界的,但你花的钱是中国政府的,所以首先考虑为中国人民服务,这个要求是恰当的。

     呵呵,我是瞎说了,自己也不搞小麦,如果说错了小麦也别搞我!



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1 徐大彬

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