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viennaRNA package 安装
高建召 2014-8-11 17:16
(1)转到该 网址网站 http://www.tbi.univie.ac.at/RNA/ (2)找到你需要的版本代码。例如选择ubuntu 下方出现两种方法。 (2-1)使用ppa法 sudo apt-add-repository ppa:j-4/vienna-rnasudo apt-get updatesudo apt-get install vienna-rna 或者 (2-2) 下载相应的ubuntu的二进制文件: ViennaRNA Packa ...
个人分类: bioinformatics|10900 次阅读|没有评论
使用 pdb文件的一些软件
高建召 2014-7-9 09:23
Software using PDB file HBPLUS http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/software/HBPLUS/ compute all possible van der Waals contacts and hydrogen bonds MOLMOL compute the relative solvent-accessible surface area of each amino acid from the protein structure. SCWRL http: ...
个人分类: bioinformatics|3360 次阅读|没有评论
Jmol 命令
高建召 2014-7-1 09:45
一个非常好的介绍 Jmol 命令的网站。 http://www.callutheran.edu/Academic_Programs/Departments/BioDev/omm/jsmol/scripting/molmast.htm http://www.callutheran.edu/BioDev/omm/surfaces/surfaces/surfaces.htm
个人分类: bioinformatics|3111 次阅读|没有评论
Python中的机器学习包 sklean
高建召 2014-1-2 16:02
Python中的机器学习包 sklean (scikit) sklean: Machine Learning in Python ======= 安装========= 0.安装scikit-learn 之前,你可能需要安装python, NumPy, SciPy, Matplotlib等。 安装说明见( http://scikit-learn.org/stable/install.html ) 1.到 sklearn 主页( http://scikit-learn.org/stable/i ...
个人分类: python|12774 次阅读|没有评论
Java 字符串 格式化输出
高建召 2013-10-14 15:24
import java.io.*; import java.util.*; public class Eg{ public static void main(String[] args) { //方法1: 使用 printf System.out.printf(==Using printfn); &nb ...
个人分类: Java|5444 次阅读|没有评论

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