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系统发育树的美化-MEGA篇(By Raindy)
热度 7 高芳銮 2014-3-26 21:27
【絮语】 MEGA作为一款简单易用的系统发育分析软件,近年日趋见于诸多国内外期刊,并慢慢受到大家的认可。对于系统发育树的后期美化,很多初学者往往觉得高深止莫测,也常常深陷于图像处理软件圈中不得其法。其实借助MEGA自带的功能,加上科究必备的Word软件和PDF专业版,足以完成系统发育树的美化处理。本文以基于最 ...
个人分类: 软件教程|42566 次阅读|10 个评论 热度 7
系统发育树重建规范流程
热度 1 高芳銮 2014-1-21 13:22
个人分类: 软件教程|17328 次阅读|1 个评论 热度 1
MEGA6 Compute core 图解教程(By Raindy)
热度 1 高芳銮 2013-12-29 16:01
【简介】 MEGA 是时下使用最为广泛的系统发育分析软件之一,因其简单易用,深受广大生物工作者青睐,尤其MEGA5加入支持ML算法以来,更是频频见于各个SCI期刊。但图形化界面的MEGA一次只能运行单次的数据处理,无法完成批量数据分析,故MEGA6发布GUI版的同时,其命令行版Compute Core(CC)也随之发布。 MEGA-CC主要 ...
个人分类: 软件教程|33598 次阅读|1 个评论 热度 1
基因的选择压力检测及检验图解教程(By Raindy)
高芳銮 2013-12-2 09:45
【絮语】   对于基因选择压力的检测,Phylogenetic Analysis by Maximum Likelihood (PAML)可能是第一反应的分析工具,但PAML的操作令不少初学者望而却步,快速完成基因的选择压力分析,推荐使用一个在线服务器Adaptive Evolution Server。 【关键】   将序列基于密码子比对后,提交序列 ...
个人分类: 软件教程|21873 次阅读|没有评论
实例图解简并引物设计(By Raindy)
热度 1 高芳銮 2013-10-29 21:34
【絮语】   设计一对合适的引物是PCR扩增目的基因成功的关键,但许多人往往过度依赖 Primer Premier(以下简称PP)或Oligo 等引物设计软件,有时候引物没设计成,却身陷软件之中无法自拔。其实,不论特异性引物或简并引物,只要掌握了几个关键点,手动也可以设计出一对好引物。如果不是大批量设计引物或设计复杂的引 ...
个人分类: 软件教程|29346 次阅读|2 个评论 热度 1
贝叶斯法重建系统发育关系
高芳銮 2013-9-19 15:20
不多言,直接上图和附件,分享给有需要的科学网战友。 相关软件及教程,可以访问我的网盘下载:http://raindy.ys168.com 本文首发于本人QQ空间(http://user.qzone.qq.com/58001704),转载烦请保留作者信息,谢谢! 建树过程中,如果任何问题,欢迎加入生物软件群(群号:323809849)交流! ...
个人分类: 软件教程|10127 次阅读|没有评论
PAUP 4已注册版,系统发育分析老牌经典软件
热度 1 高芳銮 2013-7-31 15:04
PAUP4 注册版,全功能,支持 Win7,安装后运行主程序即可。 特别感谢KuNgBiM兄帮忙解决程序过期问题! 欢迎加入生物软件交流群:323809849,交流生物软件问题! Enjoy!!更多生物软件,请访问我的网盘: http://raindy.ys168.com Raindy 2013 福州
个人分类: 软件教程|8995 次阅读|1 个评论 热度 1
MAFFT多重序列比对图解教程(By Raindy)
热度 3 高芳銮 2013-7-7 15:21
【絮语】   一提到多重序列比对,很多人禁不住就想到ClustalW(Clustalx为ClustalW的GUI版),其实有一款多重序列比对软件-MAFFT,不论从比对速度(MuscleMAFFTClustalWT-Coffee),还是比对准确性(MAFFTMuscleT-CoffeeClustalW)来说,其相比于ClustalW(或ClustalX)有过之而无不及,所以 ...
个人分类: 软件教程|55856 次阅读|4 个评论 热度 3
参考文献利器-Endnote X7 出来了,推荐更新
热度 10 高芳銮 2013-6-16 16:12
  Endnote, 不再多言,参考文献利器,科研必备。前几天就出来了,试用了几天,虽然对PDF导入功能改善不太明显,但X6等版本在插入文献后编辑文档响应慢的问题得以明显改善,推荐更新!   官方下载 : http://endnote.com/x7/ENX7Inst.exe   破解补丁 :请移步到我的网盘下载: http:/ ...
个人分类: 软件教程|23207 次阅读|18 个评论 热度 10
BioWord, a powerful biological sequence editor inside Word
高芳銮 2013-6-14 21:02
BioWord,一个Word插件,可用于 核苷酸序列和氨基酸序列 的常规操作,上图先睹为快,推荐使用! 官方网站: http://compbio.umbc.edu/3655/ BioWord is a powerful biological sequence editor operating in the most convenient of places: inside your usual word-processor (M ...
个人分类: 软件教程|6179 次阅读|没有评论

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