基因组信息挖掘分享 http://blog.sciencenet.cn/u/hsm 基因组像无标点的天书,需要慢慢理解,慢慢加标点。

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IP: 61.132.138.*   [14]shao183772136   2016-11-12 22:31
你好,认识你很高兴,想请教您一个问题,可以吗?可以加一下您的QQ吗?
IP: 159.226.67.*   [13]杨婵   2015-7-7 21:52
黄老师,您好。关于分析这一块,请问您用PHASE软件吗?我在摸索过程中遇到一些困难,能向您咨询吗?
IP: 123.151.22.*   [12]beibei88   2015-7-7 17:01
黄老师,你好,使用haploview分析LD时怎样才能调整是否划分为一个block的的标准的啊?我看使用说明没看很明白。谢谢!
IP: 180.113.86.*   [11]dbtsshome   2013-7-18 22:47
黄老师,你好!现有人和小鼠同源基因分别为A1,B1;其中A1生成两种蛋白a11,a12;B1生成一种蛋白b11,b12,b13,请问这些蛋白之间的同源关系是怎样的啊?谢谢!
我的回复(2013-7-19 21:39):A1与B1是ortholog
a11与a12是isoforms
b11,b12,b13也是isoforms
IP: 220.249.99.*   [10]赵明   2012-2-24 21:13
黄老师,您做基因组信息挖掘的呀,以后有机会向您讨教!
我的回复(2012-2-25 16:56):是的,互相学习!
IP: 202.205.91.*   [9]小醋溜呀   2011-11-11 22:18
老师您好,还是打扰您了。我使用inparanoid的软件包还是没有序列名称的输出,不知道是什么问题,请问您有inparanoid的软件包么?能帮我发一份么?我的邮箱是 keyuli.cau@gmail.com, 谢谢老师!
IP: 219.225.78.*   [8]小醋溜呀   2011-10-30 20:30
黄老师,您好,我用了inparanoid软件包,但是输出文件中没有序列,是因为参数的问题么?谢谢
我的回复(2011-10-31 17:19):输出文件只有序列名称
IP: 202.205.91.*   [7]小醋溜呀   2011-10-22 22:16
黄老师,您好,看到有人问您关于inparanoid软件包的问题,我也想请教您一个问题。用inparanoid程序的输出文件有很多,其中speciesA-speciesA,speciesB-speciesB 的文件是用于什么呢?还有其后面有很多参数,有什么意义么?
我在哪里能找到这些答案呢? 谢谢老师!
我的回复(2011-10-27 17:17):你看这个软件发布的文章就知道了。
IP: 213.22.126.*   [6]jayc   2011-9-28 02:23
黄老师,您好!

看到您发的帖子,关于illumina SNP数据的分析。我现在刚好在分析illumina SNP数据,想请教一下您是如何把最后生成Final Report、Loci Summary 和DNA Report,转换成其他snp分析软件如plink等输入格式?

期待您的回复,非常感谢!
我的回复(2011-9-28 13:54):你好!你可以咨询下华农的严建兵老师,他们做过,我们实验室还只做预实验。
IP: 58.48.72.*   [5]黄顺谋   2011-6-6 10:36
你blast先跑了没?是在blast结果的基础上计算的。
IP: 218.94.137.*   [4]万品俊   2011-5-31 10:49
黄老师您好:
inparanoid软件包怎么使用呀?我已经按照里面的readme的文件进行参数的修改运行程序,提示“starting  fist blast pass for EC-EC,输入新日期——————”然后不停的让输入日子,有的时候还提示系统无法接受的日期,请问这些日期代表什么意思?如何运行这个软件?
IP: 202.118.228.*   [3]王娟   2011-4-24 21:19
我的email:wangjuan200311037@126.com 谢谢您了,您有就麻烦您给我发一份,跪谢了
IP: 202.118.228.*   [2]王娟   2011-4-24 15:08
黄老师您好:
    您那有inparanoid软件包吗?帮我发一份吧,我现在急需用,万分感激wangjuan200311037@126.com
IP: 125.86.42.*   [1]张玺   2011-4-7 00:26
黄老师,您好!
    您那有Inparanoid软件包吗,能发给我一份吗?!谢谢!!网上这个没有EC-SC等比对后的格式例子,我比对完之后,运行Inparanoid.pl,ortholog都为0。我的邮箱是zx112266@yahoo.com.cn.
我的回复(2011-4-7 20:05):已发给你

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GMT+8, 2022-11-29 10:16

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