科学网—hsm的留言板

IP: 61.132.138.* [14]shao183772136 2016-11-12 22:31

你好，认识你很高兴，想请教您一个问题，可以吗？可以加一下您的QQ吗？

IP: 159.226.67.* [13]杨婵 2015-7-7 21:52

黄老师，您好。关于分析这一块，请问您用PHASE软件吗？我在摸索过程中遇到一些困难，能向您咨询吗？

IP: 123.151.22.* [12]beibei88 2015-7-7 17:01

黄老师，你好，使用haploview分析LD时怎样才能调整是否划分为一个block的的标准的啊？我看使用说明没看很明白。谢谢！

IP: 180.113.86.* [11]dbtsshome 2013-7-18 22:47

黄老师，你好！现有人和小鼠同源基因分别为A1，B1；其中A1生成两种蛋白a11,a12;B1生成一种蛋白b11,b12,b13，请问这些蛋白之间的同源关系是怎样的啊？谢谢！

我的回复(2013-7-19 21:39)：A1与B1是ortholog
a11与a12是isoforms
b11，b12,b13也是isoforms

IP: 220.249.99.* [10]赵明 2012-2-24 21:13

黄老师，您做基因组信息挖掘的呀，以后有机会向您讨教！

我的回复(2012-2-25 16:56)：是的，互相学习！

IP: 202.205.91.* [9]小醋溜呀 2011-11-11 22:18

老师您好，还是打扰您了。我使用inparanoid的软件包还是没有序列名称的输出，不知道是什么问题，请问您有inparanoid的软件包么？能帮我发一份么？我的邮箱是 keyuli.cau@gmail.com, 谢谢老师！

IP: 219.225.78.* [8]小醋溜呀 2011-10-30 20:30

黄老师，您好，我用了inparanoid软件包，但是输出文件中没有序列，是因为参数的问题么？谢谢

我的回复(2011-10-31 17:19)：输出文件只有序列名称

IP: 202.205.91.* [7]小醋溜呀 2011-10-22 22:16

黄老师，您好，看到有人问您关于inparanoid软件包的问题，我也想请教您一个问题。用inparanoid程序的输出文件有很多，其中speciesA-speciesA，speciesB-speciesB 的文件是用于什么呢？还有其后面有很多参数，有什么意义么?
我在哪里能找到这些答案呢？谢谢老师！

我的回复(2011-10-27 17:17)：你看这个软件发布的文章就知道了。

IP: 213.22.126.* [6]jayc 2011-9-28 02:23

黄老师，您好！

看到您发的帖子，关于illumina SNP数据的分析。我现在刚好在分析illumina SNP数据，想请教一下您是如何把最后生成Final Report、Loci Summary 和DNA Report，转换成其他snp分析软件如plink等输入格式？

期待您的回复，非常感谢！

我的回复(2011-9-28 13:54)：你好！你可以咨询下华农的严建兵老师，他们做过，我们实验室还只做预实验。

IP: 58.48.72.* [5]黄顺谋 2011-6-6 10:36

你blast先跑了没？是在blast结果的基础上计算的。

IP: 218.94.137.* [4]万品俊 2011-5-31 10:49

黄老师您好：
inparanoid软件包怎么使用呀？我已经按照里面的readme的文件进行参数的修改运行程序，提示“starting fist blast pass for EC-EC,输入新日期——————”然后不停的让输入日子，有的时候还提示系统无法接受的日期，请问这些日期代表什么意思？如何运行这个软件？

IP: 202.118.228.* [3]王娟 2011-4-24 21:19

我的email：wangjuan200311037@126.com 谢谢您了，您有就麻烦您给我发一份，跪谢了

IP: 202.118.228.* [2]王娟 2011-4-24 15:08

黄老师您好：
您那有inparanoid软件包吗？帮我发一份吧，我现在急需用，万分感激wangjuan200311037@126.com

IP: 125.86.42.* [1]张玺 2011-4-7 00:26

黄老师，您好！
您那有Inparanoid软件包吗，能发给我一份吗？！谢谢！！网上这个没有EC-SC等比对后的格式例子，我比对完之后，运行Inparanoid.pl，ortholog都为0。我的邮箱是zx112266@yahoo.com.cn.

我的回复(2011-4-7 20:05)：已发给你

基因组信息挖掘分享 http://blog.sciencenet.cn/u/hsm 基因组像无标点的天书，需要慢慢理解，慢慢加标点。

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