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centos的perl GD 画图环境配置
黄顺谋 2015-10-9 15:09
首先,安装GD作图库。yum install gd* 其次,安装perl的GD模块, http://search.cpan.org/~lds/GD-2.35/GD.pm
个人分类: 生物信息|3279 次阅读|没有评论
基因大数据和云计算在生物育种中的应用能走多快?
黄顺谋 2015-9-21 11:45
如今基因组测序成本的降低,催生了基因大数据,由此催生了云计算的应用。基因大数据和云计算在生物育种中的应用能走多快,取决于两个因素: 1 )应用工具的开发; 2 )用户的衔接; 首先讲应用的开发 。我们知道基因大数据,只是数据,如何由数据转变成有价值的知识,再由知识转变成经济价值。基因数据获 ...
3727 次阅读|没有评论
bsub批量提交任务注意事项
黄顺谋 2015-7-24 15:27
1、提交任务时脚本务必增加可执行属性,不然任务不能执行。 chmod a+x blast.sh 2、查询已提交任务 bjobs -l 3、强制杀掉任务 bkill JOBID 4、提交任务 bsub example.sh   ...
个人分类: 计算机学习|11299 次阅读|没有评论
不要被“市场化”蒙蔽了眼睛
热度 2 黄顺谋 2015-6-19 22:31
国内油菜籽产量今年大幅减少,有些人认为是市场化的结果。因为加拿大的油菜籽运到国内的价格比本国产的菜籽还便宜。但是,政策制定者应该考虑,这是由于本国的特殊国情导致的,因为农村没有实现 规模化生产,生产成本高导致。随着城市化进程加快,我国将会逐渐实现农业规模化生产。我们不能为了目前的“市场化” ...
3170 次阅读|4 个评论 热度 2
新形势下作物遗传育种该如何做?
黄顺谋 2015-5-31 17:16
Illumina 最新的测序仪已经上市,一个 run 产生 1.5T 数据,只需要三天半时间,测序成本约 250 元 /G 。水稻基因组约 430M ,使用 2b-RAD 技术分型一个 100 株系的作图群体仅需要 1.25 万元,这在几年前是不可想象的,以前使用 SSR 光引物成本就需要 9600 元,试剂和人工成本就更高了。以前一个实验 ...
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光合组学(phytozomics)——你了解么?
黄顺谋 2015-5-31 15:24
Phytozomics,光合组学,是研究生物光合作用所涉及基因的一门学科。所有植物都涉及光合作用, 包括 微生物微藻。 光合作用实现了太阳能的固定,为异养生物的生存创造了条件。 大约 15亿年前, 鞭毛菌首先与光合 细菌共生,生成有光合功能的蓝澡细菌,蓝澡细菌再与线粒体共生,生 ...
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