转录组是基因组与基因功能的链接。为了了解基因组与细胞功能的关系，科学家普遍通过基因组的产物（RNA或Protein）来研究。蛋白组是某个细胞或组织的一整套蛋白，包含量的信息和序列信息，但是由于目前蛋白质俘获技术不够成熟，所以目前利用蛋白质来进行大量的功能基因组研究时期还没有到。但是，度量gene与protein的中间体（RNA）目前技术相当成熟，可以大批量地开展。

    转录组是基因活动的标志物。在多细胞的生物体，虽然每个细胞包含相同的基因组和基因，但是并不是每个基因在每个细胞都表达或表达的模式是一样的。通过不同细胞和组织的转录组研究，

    1）可以理解某个细胞类型构成的特征；

    2）可以深刻地理解疾病引起基因表达变化的特征；

    3）可以解读不同发育阶段基因表达的特征；

    4）可以研究ohnologs间的表达动态特征，了解基因分化的奥秘；

    5）可以研究基因突变对那些基因的表达产生影响；

    6）可以研究那些突变（启动子和编码区）更能影响基因本身的表达或者下游基因的表达；

    只有很少一部分基因组转录成RNA，人类基因组有5%转录成RNA（Frith et al., 2005）。而且大部分转录的RNA是非编码RNA（tRNA,rRNA,microRNA等）。mRNA也包含很多变异，包括可变剪接，RNA编辑，转录起始位点变异和终止位点变异。

原文链接：http://www.nature.com/scitable/topicpage/transcriptome-connecting-the-genome-to-gene-function-605

Frith, M. C., et al. Genomics: The amazing complexity of the human transcriptome. European Journal of Human Genetics 13, 894–897 (2005) doi:10.1038/sj.ejhg.5201459