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Indel的开发

已有 4628 次阅读 2010-5-7 11:01 |个人分类:未分类|系统分类:科研笔记| InDel

InDel is used to mean an insertion or a deletion. 最近用novoalign(http://www.novocraft.com/)软件做了InDel的开发,novoalign可以找到长达7bp的InDel(http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=327),参数设置为InDel长度4bp以上,重复4次以上。然后用PAGE胶检测20个样本,居然没有一个InDel能很好地检测出来,在PAGE胶上的差异不大。可能是软件问题,也可能是PAGE胶的浓度过低,没有被检测出来。

https://wap.sciencenet.cn/blog-442719-320943.html


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