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Trey Ideker关于生物网络中模块识别的最新综述

热度 1 2013-9-21 17:53

Mitra et al. Integrative approaches for finding modular structure in biological networks. Nat Rev Genet 2013, 14:719-732. http://www.nature.com/nrg/journal/v14/n10/abs/nrg3552.html Abstract: A central goal of systems biology is to elucidate the structural and functional architecture of the cell. T ...

个人分类: 科研笔记|5027 次阅读|1 个评论 热度 1

FastDMA: 全基因组DNA甲基化芯片数据快速分析工具

热度 1 2013-8-3 08:49

1、支持分析Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip 2、计算性能高：分析速度快、占用内存少、支持多核多进程 3、多种差异DNA甲基化分析模式：单位点分析、预设区域分析、全基因组区域分析 4、提供多种注释：CpGi、基因、miRNA等 软件免费下载地址 http://bioinfo.au.tsinghua.edu.cn/software/fastdma ...

4852 次阅读|2 个评论 热度 1

【期刊与会议】生物信息学与系统生物学

热度 1 2012-11-15 20:13

生物信息学、系统生物学是交叉学科，可选择期刊比较广泛，这里只列举一些平时关注的刊物： -------------------------------------------- Nature Biotechnology Nature Methods 上述两个刊物有Computational Biology相关的栏目，顶尖的生物信息学研究成果（偏理论、方法） Proceedings of the National Academy of ...

6821 次阅读|1 个评论 热度 1

“分类”产生的知识

热度 2 2012-6-11 21:20

人类的新知识来自于哪里？古希腊的哲学家们早已开始思索。最近复杂科学领域也一直关注相关的问题。我没系统研究过哲学，只是根据自己的经验，特别是在信息处理方面的经验总结出：很多新的知识来自于“分类”。 先说分类吧：所有信息混合在一起是没有意义的，首先要确定某一个尺度、定义一个标准，将混合的信息进行分离。我 ...

3195 次阅读|2 个评论 热度 2

第一个本本差不多可以下岗了

2012-4-30 23:08

05年，拿着第一笔打工赚到的7700外加若干年奖学金攒的钱买了当时还颇高级的IBM ThinkPad X31（注：当时ThinkPad刚被联想买了，不过这批机子还是IBM标的）。当时还是通过Shen院士拿的联想员工内部价，便宜了1、2千吧。大学四年家里经济还蛮紧张，还好外公外婆每个月还另外给500生活费，那时候吃饭买个大鸡腿，刷饭卡超过5块 ...

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