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BMC PB: 福建农林大学麻类研究室揭示赤霉素GA3处理下参与黄麻纤维形成的WRKY转录因子

已有 1526 次阅读 2020-9-1 21:52 |个人分类:Research articles|系统分类:论文交流

           2020年9月1日,福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/农学院麻类研究室在国际期刊《BMC Plant Biology》(BMC植物生物学)(植物科学Q1区,IF=3.497)在线发表了题为“De novo assembly of transcriptome and genome-wide identification reveal GA3 stress-responsive WRKY transcription factors involved in fiber formation in jute (Corchorus capsularis)”(转录组从头组装和全基因组鉴定揭示赤霉素GA3处理下参与黄麻纤维形成的WRKY转录因子)的研究论文。

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 WRKY基因家族是一类只存在于植物中的转录因子,在对植物生长发育和环境胁迫的防御反应中起着重要作用。该研究以黄麻优良品种“Huangma 179”(黄麻179)和赤霉素敏感型矮秆种质“Aidianyehuangma”(爱店野黄麻)为材料,通过转录组测序,共鉴定了43个CcWRKY转录因子。系统发育关系和基因结构分析表明,这些基因具有功能多样性。

为了评价赤霉素GA3处理下CcWRKY在纤维形成中的作用,选择次生细胞壁生物合成相关基因作为标记基因,分析了应答GA3处理4h和72h后的WRKY转录因子在茎皮中的表达模式。获得了在两个品种中表达量存在显著差异的21个CcWRKY。顺式作用元件分析表明,这21个CcWRKYs的启动子中均有1~4个赤霉素响应相关元件。说明在GA3处理下,它们可能参与调节黄麻纤维的形成。这些为进一步阐明CcWRKY在黄麻纤维发育中的作用机制奠定了基础。

福建农林大学农学院麻类研究室博士研究生张力岚为论文的第一作者,张立武教授为通讯作者。研究得到国家自然科学基金项目(31771369)和国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-19-E06)等经费资助。


原文链接:https://bmcplantbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12870-020-02617-8




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