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linux操作| 高压化学| 计算相关| 高压实验|
vasp+ifc2015 debug其二
董校 2022-3-16 00:33
vasp6.3使用了部分fortran08以上写法，导致ifc2015版本不支持的问题。之前用ifc2018编译过了，不过天河上的ifc2018动么动就抽风，报daplfabic错误（原因似乎是某些节点上的dapl版本太老，不同节点上的文件版本竟然不一致，也不知道怎么配出来的）。于是今天晚上心一横，索性强行改一下vasp的源代码，看看能不 ...
个人分类: linux操作|1437 次阅读|没有评论
vasp的编译问题
董校 2022-1-28 17:12
之前在忙编译vasp6，在使用了一段时间之后又发现了另外的一些问题，具体表现为在特定的cpu上面会出现 severe (168): Program Exception - illegal instruction报错。 查了好久，终于找到解决办法，就是在编译的时候添加 -msse3选项，即在makefile.include里面添加： FC = mpii ...
个人分类: linux操作|3199 次阅读|没有评论
anaconda虚拟环境的搭建
董校 2020-4-10 17:34
最近计算问题需要在天河新集群上面搭建anaconda环境（非root）账户（安装phonopy，感觉安装pymatgen也应该是一样的）。具体操作如下： 加载集群默认的anaconda（我需要python2）所以使用anaconda2： module load anaconda2/ 创建私有环境： conda create -n phonopy -c conda-forge python=2.7 进入私有环境： ...
个人分类: linux操作|4716 次阅读|没有评论
matlab占用linux库的解决办法
董校 2017-1-9 23:55
matlab在使用unix命令时很多时候会用自己的库替代系统内建或者在环境变量中已经设定好的库，这个行为会导致使用unix命令执行的程序失败。 解决方法其实很简单，就是使用环境变量 export LD_PRELOAD='***.so:*****.so.1'。 现在还遗留两个问题： 1.不知道怎么使用LD_PRELOAD加载目录 2.不知道这种环境变量替代 ...
个人分类: linux操作|3325 次阅读|没有评论

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