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XP应用指南-解析单晶

已有 6660 次阅读 2009-5-1 11:25 |个人分类:精读资料|系统分类:科研笔记| 单晶, XP应用指南, 解析

1. 进入界面
直接点击XP.exe的应用程序图标。或者从命令提示符进入。
2. 如何打开一张RES图?
(1) 首先确定RES扩展名的文件的位置及其文件名。然后将其拷到XP所在的文件夹中。 例如:在我的文档中有一个08122m . res的文件
(2)在XP的界面中如下操作:
XP》read 08122m
XP》fmol
按enter键后,会出现一系列数据标示。按enter使屏幕滚动,提示符重新出现。
XP》mpln/n (选择项)(分子沿对称轴方向定向)
屏幕出现x . y . z 轴坐标。
XP》proj
即可进入08122m的XRD结构图,右上角有一系列命令
3. 如何只显示部分图形?
方法一:XP》pick
屏幕出现一张结构全图,并自动扫描各键。确定拟保留和除去的键及原子,然后当扫描到某个键时,按“空格键”保留该键,按“enter”键删除该键。依次操作。依次操作直至满足要求。
① 当误删时,按“backspace”即可恢复上步操作。
② 处理完毕,按“ESC”返回至XP》____ 状态。但保留处理。
③ 处理完毕,按“?/”键即可将处理后的图保留下来。
④ 当扫描到某个原子时,可键入元素符号和数字来改变原子的编号。
方法二:XP》pick $C
则光标自动扫描所有C原子。按“空格键”或“enter”键来决定是逐个保留还是删除。
方法三:XP》kill P1
此法需要在已知拟删原子的坐标符合之后才能运用。否则很容易误删。上面的命令可删除结构图上的P1原子,然后给出“一个原子被删”的提示后直接回到XP》_____.
以上三个方法均可用通配符“?”或“*”,C1 to C6
4. 如何进行晶胞堆积?
(1) 按X,Y或Z轴方向堆积:
XP》matr 1 (按X方向堆积)
XP》matr 屏幕会给出一系列参数
XP》pack 屏幕会给出在一定长、宽范围沿X轴的晶胞堆积图,用红蓝两色给出。若戴上一幅红蓝镜片的眼镜,则可看到立体图。如果要贮存,在退出时选择右上方“SGEN/FMOL”命令,那么接下来用PROJ命令打开时,即为该图,而不是以前的单晶。若想恢复到最初的单晶胞图,则用XP》fuse命令即可。
(2) 按自定方向堆积
先用XP》proj 命令打开一张图。
再用其中的rotate选项选择合适的方向,退出。
然后XP》pack 可显示所选方向的晶胞堆积图。
5. 有关旋转的两个快捷键:
① 选中旋转命令,按enter键可均匀缓慢旋转,在按下可停止RV
② 在缓慢RV时,若按下空格键可加速选转,再次按下可恢复慢速。
6. 修改显示空间
XP》pbox 屏幕显示图形区域的长、宽值(默认20A,80A)
XP》pbox 30 10 将区域改为30A、10A
XP》pack 即可看到更多晶胞堆积在一定区域内。
7. 如何求二面角?(以a.res为例)
XP》read a
XP》fmol Cu1 P1 P2 N2 N4 C40 C41 C42 (将两个面上的原子)
XP》mpln Cu1 P1 P2 (列出第一个面上的原子)
XP》mpln C40 C41 C42 N3 N4 (列出第二个面上的原子)
给出第二个面与第一个面的二面角值。
8. 如何显示部分图形?
XP》read a (读入文件a.res)
XP》fmol C1 C2 C3•••••(列出所要显示的原子)
XP》
XP》proj
即可显示部分图形。
9.除两个原子间的连接:
XP》undo P1 P2
10.如何将晶体对称生长完全?
XP》grow
11.用diag命令可将图形放于屏幕的右上角,方便以后编辑(如kill、pick等)
12.如何给出与Cu1所连接各原子的键长和键角?
XP》bang Cu1
13.如何退出XP?
XP》quit
14.如何测量两个并不相连的原子的距离?
XP》envi x n
X:代表某个原子序号 n :为自然数
该命令可以求出距离x原子n倍正常键长范围内所有原子与该原子的距离,并且 给出所有以x原子为中心的各连线之间的夹角。
15.如何测量两个平行平面间距?
XP》cent/x ______ (一个平面S1上原子)
将给出这个平面中心一点X1A
XP》mpln ______ (另一个平面S2的原子)
将给出X1A到S2的垂直距离。
如何平面S1和S2中心之间的距离?
可以用同样的方法求出平面S2的中心X1B,然后用envi命令求出X1A到X1B之间的
距离。
16.如何保存一张处理过的图形?
当用完pick或kill命令后,可用proj命令显示出处理的结果。当把它调整到适当的角度后,退出,并用save命令可将其保存下来。
XP》save (键入一个文件名)
XP》telp 0-30
出现一大堆数据。当出现plotfile时,键入一个文件名,然后出现一张热椭球图形,可对其进行原子编号。(可移动鼠标来确定编号的位置,enter 键:跳过编号原子,space键:确定编号。)当完成编号后,键入“b”、“空格”,此按键可将上述处理保存为一张plt的文件。
17.如何作出能粘贴到word中的图?
① 得到*.plt后,在XP中draw ____ (键入文件名)
然后出现一堆参数要求选择:h (可将其存为hgl文件)
a (可存为ps文件)
a4
即可得到*.hgl文件
在word中即可插入。
② 把附件hpg.zip解压成hpg.reg ;hpglim32.flt
把文件copy到C:program filescommom fileMicrosoft sharedgraphflt
双击hpgl.reg 使其注册
18.如何回到以前已经保存过的一张*.sav的图形?
XP》read *.res
XP》fmol
XP》mpln/n
XP》next _____ 键入想要调出的文件名(后缀为sav)
19.如何将不完整的分子结构图画完全?
可以将一个原子沿着它所连接的原子逐个生长出去。
XP》envi (键入一个原子,假如a)
显示与该原子相连的其他原子符号(假如b),以及内部编号(****)
XP》sgen b ****
XP》proj
可显示b原子,用此法可将一整个链画完整。
20.查看晶胞参数的命令?
XP》cell
21.查看是否有空洞的命令?
将结构晶胞堆积图旋转到一定方向后 XP》spix 即可出现一张结构堆积图。

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