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Gromacs 结果分析

已有 6979 次阅读 2014-9-25 22:49 |个人分类:计算机|系统分类:科研笔记

刚开始学 Gromacs 还不会分析结果。

(1) 从轨迹中提取某一帧

trjconv -f md.xtc -s md.tpr -sep -b 30000 -e 30000 -o x.pdb

这项命令的好处是:可以只提取出某一类分子在 30000 时刻的位形,输出到 x.pdb。在运行该命令的时候系统会让你选择输出哪种分子。


以后不断更新 ...



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