陈文峰的博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/陈文峰 专注于根瘤菌的研究

博文

根瘤菌新成员:微枝形杆菌属(Microvirga)的三个新种

已有 7015 次阅读 2011-12-28 06:51 |个人分类:根瘤菌分类|系统分类:科研笔记| 根瘤菌新成员, Microvirga

IJSEM新近在线发表了三个新种,都属于微枝形杆菌属(Microvirga),分别为:Microvirga lupini sp. nov., Microvirga lotononidis sp. nov., and Microvirga zambiensis sp. nov.,宿主为Listia angolensis (from Zambia) and Lupinus texensis (from Texas, USA)。
该项工作是由澳大利亚根瘤菌研究中心的人从豆科植物上分离的根瘤菌,但属于不常见的属,微枝形杆菌属。
LPSN上的关于Microvirga属的种见:http://www.bacterio.cict.fr/m/microvirga.html
 
摘要如下:

Strains of Gram-negative, rod-shaped, non-spore-forming bacteria were isolated from nitrogen-fixing nodules of the native legumes Listia angolensis (from Zambia) and Lupinus texensis (from Texas, USA). Phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene showed that the novel strains belong to the genus Microvirga, with 96.1 % or greater sequence similarity with type strains of this genus. The closest relative of the representative strains Lut6T and WSM3557T was M. flocculans TFBT, with 97.6-98.0 % similarity, while WSM3693T was most closely related to M. aerilata 5420S-16T, with 98.8 % similarity. Analysis of the concatenated sequences of four housekeeping gene loci (dnaK, gyrB, recA, rpoB) and cellular fatty acid profiles confirmed the placement of Lut6T, WSM3557T and WSM3693T within Microvirga. DNA:DNA relatedness values and physiological and biochemical tests allowed genotypic and phenotypic differentiation of Lut6T, WSM3557T and WSM3693T from each other and from other validly published Microvirga species. The nodA sequence of Lut6T was placed in a clade that contained strains of Rhizobium, Mesorhizobium and Sinorhizobium, while the 100 % identical nodA sequences of WSM3557T and WSM3693T clustered with Bradyrhizobium, Burkholderia and Methylobacterium strains. Concatenated sequences for nifD and nifH show that Lut6T, WSM3557T and WSM3693T were most closely related to Rhizobium etli CFN42T nifDH. On the basis of genotypic, phenotypic and DNA relatedness data, three novel species of Microvirga are proposed: Microvirga lupini (Lut6T = LMG26460T, = HAMBI 3236) Microvirga lotononidis (WSM3557T = LMG26455T, = HAMBI 3237) and Microvirga zambiensis (WSM3693T = LMG26454T, = HAMBI 3238).



http://wap.sciencenet.cn/blog-3533-522785.html

上一篇:《细菌名称双解及分类词典》正式出版
下一篇:耐重金属、促生及结瘤固氮的紫穗槐中慢生根瘤菌基因组草图发表

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2021-12-1 15:36

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部