博文
- My current knowledge/ideas in evolutionary cancer research
- It just sounds natural that a bunch of somatic cells in a multi-cellular body can be viewed as a population while evolutionary/ecological theories can be used to look into the population dynamics of these cells, and it sounds tempting that theoretical works my find their application in cance ...
- Before making use of evolutionary theories
- When making preparation for an interview, I asked a few questions to myself. I couldn't answer them very well, but just tried to give some comments. 1. The first question is what 'evolutionary theories' really mean. I could only answer this question based on what I have learned. Certainly my favori ...
- 欧洲杯小组赛：从出线结果倒推游戏规则？
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- 本次欧洲杯小组赛出线规则如下： 小组赛积分相同的球队的排名方式按照以下顺序进行： a.球队之间的胜负关系（三球队积分相同时则通过这些球队交战的总积分判定） b.球队之间的净胜球数（在两支以上球队处于同分的情况下） c.球队之间的总进球数（在两支以上球队处于同分 ...
- A game between an individual and a population: rationale
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- 这是本系列的第二篇 (首发于本人 英文博客 )，对上一篇提出的想法作了更细致一点的介绍，并引出后面的话题。下一篇才是最重要的，先在此预告一下～ 2012年4月23日追记：昆明动物所王瑞武老师基于榕小蜂的一系列研究，已经包含了这个思路。参见这两篇论文Wang et al. 2009 ( doi:10.1371/journal.pone.0007802 )， ...
- A game between an individual and a population: Introduction
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- 前几天似乎想明白了点什么，仔细一想又不太明白。一些已经想通了的，先记在这里。后面的再继续想。（亦公布于本人 英文博客 。）其实跟先前的狼-羊博弈同属多层博弈，但不同之处在于这里存在‘结构’。例子估计很好懂。我觉得将博弈的任一方扩充为一个群体，并且考虑这一方存在的内部博弈，可能对细胞、生化层次的分子间博 ...
- 随记 关于dynamical systems与细胞生物学
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- 首先检讨一下：我最近一年来所感兴趣的话题，应该算是dynamical systems理论；它需要一些网络理论作为基础，但不能算是后者的一部分。关于Kauffman的NK网络模型与Wolfram的Automata在实质上是同一个东西，其实早就有人总结过了。之前一篇综述（ Cershenson，2004 ）就提到过，今年又有一篇论文（ Kayama，2011 ）将之公式 ...
- 《美丽心灵》观后
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- 今天在微博上假装看过这部电影，实际上只是久闻其名而已。不过随后还是完整地观看了一遍，过程那个惊悚……还好是个圆满的结局。 看到一半的时候，相信和多数观众一样，我也不相信纳什的室友怎么可能是虚幻的，还觉得精神病一说应该是一个阴谋。直到剧情继续推进，心中的迷雾才慢慢散去。随着主角慢慢地意识到自己的人格分 ...
- Maxima 练习两则
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- 趁周日有空，试做了一下运动轨迹模拟。自己还算满意 不过要是把数组再搞明白一点，能把原代码写得再简洁一些就更好了。先上图。详情见 英文博客 。
- 读书笔记：关于miRNA （一）
- 本文亦发布于本人 英文博客 。 During the last two months Ihave read several papers on miRNAs. I noticed miRNAs because they compose an important part of gene regulatory networks and recent discoveries have shown miRNA manipulation can do the job of the transcriptio ...
- R软件更新
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- 好久没用R，竟然也没注意应该升级到最新版了。 在windows下面比较好办，卸掉旧版，直接下载安装最新版即可。 在ubuntu下，添加源： http://ftp.heanet.ie/mirrors/cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu lucid/ （因为我的ubuntu是10.04，所以是lucid。因为我在爱尔兰，所以用heanet.ie的镜像。） 之后在终端下导入需要的k ...
