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My current knowledge/ideas in evolutionary cancer research
党晓栋 2012-10-20 17:28
It just sounds natural that a bunch of somatic cells in a multi-cellular body can be viewed as a population while evolutionary/ecological theories can be used to look into the population dynamics of these cells, and it sounds tempting that theoretical works my find their application in cance ...
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Before making use of evolutionary theories
党晓栋 2012-10-11 11:21
When making preparation for an interview, I asked a few questions to myself. I couldn't answer them very well, but just tried to give some comments. 1. The first question is what 'evolutionary theories' really mean. I could only answer this question based on what I have learned. Certainly my favori ...
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欧洲杯小组赛:从出线结果倒推游戏规则?
热度 2 党晓栋 2012-6-16 06:23
本次欧洲杯小组赛出线规则如下:    小组赛积分相同的球队的排名方式按照以下顺序进行:   a.球队之间的胜负关系(三球队积分相同时则通过这些球队交战的总积分判定)   b.球队之间的净胜球数(在两支以上球队处于同分的情况下)   c.球队之间的总进球数(在两支以上球队处于同分 ...
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A game between an individual and a population: rationale
热度 1 党晓栋 2012-2-15 19:30
这是本系列的第二篇 (首发于本人 英文博客 ),对上一篇提出的想法作了更细致一点的介绍,并引出后面的话题。下一篇才是最重要的,先在此预告一下~ 2012年4月23日追记:昆明动物所王瑞武老师基于榕小蜂的一系列研究,已经包含了这个思路。参见这两篇论文Wang et al. 2009 ( doi:10.1371/journal.pone.0007802 ), ...
个人分类: thoughts|4801 次阅读|2 个评论 热度 1
A game between an individual and a population: Introduction
热度 1 党晓栋 2012-2-6 03:27
前几天似乎想明白了点什么,仔细一想又不太明白。一些已经想通了的,先记在这里。后面的再继续想。(亦公布于本人 英文博客 。)其实跟先前的狼-羊博弈同属多层博弈,但不同之处在于这里存在‘结构’。例子估计很好懂。我觉得将博弈的任一方扩充为一个群体,并且考虑这一方存在的内部博弈,可能对细胞、生化层次的分子间博 ...
个人分类: thoughts|5656 次阅读|3 个评论 热度 1
随记 关于dynamical systems与细胞生物学
热度 2 党晓栋 2011-11-12 07:42
首先检讨一下:我最近一年来所感兴趣的话题,应该算是dynamical systems理论;它需要一些网络理论作为基础,但不能算是后者的一部分。关于Kauffman的NK网络模型与Wolfram的Automata在实质上是同一个东西,其实早就有人总结过了。之前一篇综述( Cershenson,2004 )就提到过,今年又有一篇论文( Kayama,2011 )将之公式 ...
个人分类: thoughts|5558 次阅读|3 个评论 热度 2
《美丽心灵》观后
热度 4 党晓栋 2011-7-17 04:23
今天在微博上假装看过这部电影,实际上只是久闻其名而已。不过随后还是完整地观看了一遍,过程那个惊悚……还好是个圆满的结局。 看到一半的时候,相信和多数观众一样,我也不相信纳什的室友怎么可能是虚幻的,还觉得精神病一说应该是一个阴谋。直到剧情继续推进,心中的迷雾才慢慢散去。随着主角慢慢地意识到自己的人格分 ...
个人分类: thoughts|3968 次阅读|5 个评论 热度 4
Maxima 练习两则
热度 1 党晓栋 2011-5-30 17:49
趁周日有空,试做了一下运动轨迹模拟。自己还算满意 不过要是把数组再搞明白一点,能把原代码写得再简洁一些就更好了。先上图。详情见 英文博客 。
个人分类: thoughts|3724 次阅读|2 个评论 热度 1
读书笔记:关于miRNA (一)
党晓栋 2011-5-2 07:16
本文亦发布于本人 英文博客 。 During the last two months Ihave read several papers on miRNAs. I noticed miRNAs because they compose an important part of gene regulatory networks and recent discoveries have shown miRNA manipulation can do the job of the transcriptio ...
个人分类: thoughts|4804 次阅读|没有评论
R软件更新
热度 1 党晓栋 2011-3-31 06:53
好久没用R,竟然也没注意应该升级到最新版了。 在windows下面比较好办,卸掉旧版,直接下载安装最新版即可。 在ubuntu下,添加源: http://ftp.heanet.ie/mirrors/cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu lucid/ (因为我的ubuntu是10.04,所以是lucid。因为我在爱尔兰,所以用heanet.ie的镜像。) 之后在终端下导入需要的k ...
个人分类: thoughts|7888 次阅读|1 个评论 热度 1

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