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流式荧光补偿对照的选择, cells or beads?
热度 1 张千君 2010-1-13 07:54
流式分析中,选择好的对照几乎是实验中最重要的步骤。没有正确的对照,不管你的实验结果怎样 意义 重大,那些实验数据就是数字垃圾,没有任何意义。 对照有很多种,你的实验对照,如,未染色细胞,未刺激细胞,异型对照等等。 还有就是实验方法对照,如,荧光补偿对照,FMO (Fluorescence minus one) 那么接下 ...
个人分类: FlowJo使用|14920 次阅读|1 个评论 热度 1
什么是FMO( Fluorescence minus one)?
张千君 2010-1-13 06:33
个人分类: FlowJo使用|6876 次阅读|没有评论
Cluster 功能的使用
张千君 2010-1-7 08:30
Cluster 是MAC版本专属的一个功能,它主要是用来自动检测细胞群,对于分析你不是很熟悉的细胞群有很大的帮助。 在流式分析时,你打开一个数据窗口,不知道你的细胞群怎样分布,不知道设门的时候。可以借用此工具。 例如这个数据, 你不知道那个细胞群是淋巴细胞。 你可以先选中那个FCS数据,然后到菜单Platfromc ...
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更新 FlowJo beta 测试下载
张千君 2010-1-6 06:05
FlowJo 是由生命科学家设计,应用于科学家的一款细胞流式分析软件( By Scientist and For Scientist)。在斯坦福大学研发,1997年由 Treestar 公司发布。 迄今以来,其友好的界面设计,强大的分析功能已经吸引了很多忠实的用户和狂热的爱好者。是界内最受推崇的一款分析软件。 FlowJo 也一直在不断的开发中,根据用户的反 ...
个人分类: FlowJo使用|5887 次阅读|3 个评论
FlowJo 里的组合门
热度 2 张千君 2010-1-6 05:47
在FlowJo里,你可以使用组合门的功能来界定你想要查看的细胞群,例如,CD3 AND NOT CD4 AND NOT CD8, 或者看所有会产生细胞因子的T cell, T cells AND IL-2 OR IFNg OR TNFa(只要是产生里面任意一个因子的T cell 都包括在内) 这个功能对测多个细胞因子的实验室有很大的帮助。 如何使用Flo ...
个人分类: FlowJo使用|12357 次阅读|3 个评论 热度 2
FlowJo 的讲座海报和预防甲流的洗手液广告
张千君 2010-1-4 14:08
这是一张 用手机拍的 质量糟糕的照片。 10月份的时候在中国几个学校里做FlowJo的讲座。在一个学校里看到我的讲座海报和预防甲流的洗手液广告贴在了一起。感觉挺好玩,就用iphone 照了下来。 Flow Cytometry Vs H1N1, 以这种奇妙的方式组合在一起,不错!
个人分类: FlowJo 会议及讲座安排|5160 次阅读|没有评论
硬件补偿和软件补偿的选择
张千君 2010-1-4 06:54
每个做流式细胞研究的人都有这样的经历,非常紧张的在流式仪上调节各个通道的荧光补偿值, 要注意对照细胞管液体不要跑完,还要查看各个荧光参数轴之间的细胞群分布情况,确定自己做了正确的调整。有时候,收集完数据后发现过渡补偿了, 对着自己的数据手足无措, 不得不从新跑样品。这是 我当年做流式的一个梦魇! 流 ...
个人分类: 流式知识|8406 次阅读|没有评论
如何确定流式分析中荧光补偿是正确的呢?
张千君 2010-1-4 06:12
How to determine the correct compensation during your Flow Cytometry data analysis? The principle: the median of the positives population is equal to the median of the negatives population. 也就是说要确定你的阳性细胞群和阴性细胞群的中位数要一致。背后的机理请看我的前一篇文章, 荧光补偿基础 ...
个人分类: 流式知识|17759 次阅读|没有评论
如何确定你电脑的JAVA 版本
张千君 2010-1-2 14:19
JAVA 版本有时候会影响你电脑的一些应用软件的运行,最简单的查看你的电脑上安装的JAVA 版本的方法如下 PC: StartRun, 输入CMD,enter, 在弹出的窗口输入 Java -version, hit enter, 下方就会显示你的Java version 了。 MAC: 1. Open the Hard Drive 2. Open Applications, then Utilities 3. Op ...
个人分类: FlowJo使用|16766 次阅读|2 个评论

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