博文

蝙蝠中的人兽共患病和病毒基因组的多样性（6）

已有 2581 次阅读 2022-2-18 12:14 |个人分类:科学普及|系统分类:科普集锦

蝙蝠中的人兽共患病和病毒基因组的多样性(6)

前记：蝙蝠可能是多种人兽共患病的来源，但蝙蝠也是地球生态系统中不可或缺的重要组成部分，而且蝙蝠是目前处于濒危状态需要重点保护的物种。应正确认识新冠病毒、狂犬病毒和其他多种病毒与蝙蝠的关系，应在科学认识和有效控制病毒性传染病的同时，进一步加强对蝙蝠的保护。蝙蝠现在比以往任何时候都更需要我们的保护。

本文通讯作者Edward C Holmes 是国际著名进化生物学家和病毒学家，澳大利亚科学院院士，悉尼大学研究员和教授，也是上海复旦大学的荣誉客座教授。本文发表在本月最新出版的国际专业杂志《Current Opinion in Virology（病毒学时论）》上。本博客将陆续摘要译介此文的内容。

本文的目录：

一）引言

二）蝙蝠的病毒基因组的多样性

三）与蝙蝠有关的值得注意的人兽共患病的暴发

1）冠状病毒科（Coronaviridae）

2）副粘病毒科（Paramyxoviridae）

3）弹状病毒科（Rhabdoviridae）

四）为什么蝙蝠能成为众多病毒的储存宿主?

五）蝙蝠病毒基因组的挑战

六）结论——蝙蝠的未来尚难以预测

三）与蝙蝠有关的值得注意的人兽共患病的暴发

2）副粘病毒科（i）

对蝙蝠副粘病毒（paramyxoviruses）的兴趣始于亨德拉病毒（Hendra）、尼帕病毒（Nipah）和梅那哥病毒（Menangle）的发现(见下文）。此后，大量的蝙蝠副粘病毒被鉴定出来，显示出相当大的系统发育多样性(图4)。例如，在中国的一项mNGS（宏基因组学下一代测序）研究中，在9种蝙蝠中发现了14种新的蝙蝠副粘病毒。而2020年，在一份来自黄毛果蝠（Eidolon helvum）的尿液样本中发现了一种新型蝙蝠副粘病毒阿奇莫塔副腮腺炎病毒3(Achimota pararubulavirus 3，简称AchPV3)。亨德拉病毒(亨尼帕病毒属，副粘病毒科)于1994年在澳大利亚昆士兰州首次报道引起马急性呼吸道疾病和人脑炎，最初曾导致16匹马和2名与病马接触过的人死亡。

在对2000匹马针对该病毒进行血清学检测得到全部呈阴性的结果后，有人认为该病毒可能起源自野生动物，黑狐蝠(Pteropus alecto)、灰头狐蝠(Pteropus poliocephalus)、眼镜狐蝠(Pteropus atus)和小红狐蝠(Pteropus scapulatus)后来都被证实携带针对该病毒的中和抗体。亨德拉病毒后来在一只灰头狐蝠的分娩液和胎儿组织以及一只黑狐蝠（black flying fox）的胎儿组织中得到证实，蝙蝠尿液中也普遍存在亨德拉病毒。因此，尿液可能是从蝙蝠传播给马的可能方式，感染亨德拉病毒的马随后再通过呼吸道分泌物传播给其他的马和人。

图4. 蝙蝠副粘病毒的代表性系统发生（phylogenetic）的多样性。

依据L蛋白的氨基酸序列进行排比（alignment），其中含有副粘病毒科的RdRp（依赖于RNA的RNA聚合酶），采用IQ-TREE软件来构建最大似然树。这棵树是以中点（mid-point）为根（root）的,其中引导值（bootstrap values）用有色圈表示。蝙蝠病毒以红色字体显示。如果在病毒名称中未提供宿主物种的名称，则代表动物宿主物种的动物轮廓图被显示在该病毒名称的右边。鸟类（avian）副粘病毒进化分支（clade）已被简化,以增强视觉效果。

参考文献：

Kate Van Brussel and Edward C Holmes，Zoonotic disease and virome diversity in bats，Current Opinion in Virology，Volume 52, February 2022, Pages 192-202，https://doi.org/10.1016/j.coviro.2021.12.008